RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475321.5

RBBP4-210, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, humanhuman

TSL 5

Gene RBBP4, Length 619 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4-210ENST00000475321 CRISP2P16562 243 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 ZNF19P17023 458 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 IVDP26440 423 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 DRD3P35462 400 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 NSG1P42857 185 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 SLCO1A2P46721 670 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CCR8P51685 355 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 PLTPP55058 493 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 RWDD2BP57060 319 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 TGFBR3Q03167 851 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 ZNF92Q03936 586 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 ECH1Q13011 328 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 GPNMBQ14956 572 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 NCF4Q15080 339 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 LRRC26Q2I0M4 334 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 PTPN20Q4JDL3 420 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 LRRC10Q5BKY1 277 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 TMEM255AQ5JRV8 349 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 VAX1Q5SQQ9 334 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 LIN9Q5TKA1 542 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 REEP3Q6NUK4 255 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 SPESP1Q6UW49 350 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 C6orf89Q6UWU4 347 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 KATNAL2Q8IYT4 538 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 PNKDQ8N490 385 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 JAGN1Q8N5M9 183 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 EID2Q8N6I1 236 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 OTUD6BQ8N6M0 293 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 ZNF740Q8NDX6 193 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CCDC54Q8NEL0 328 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 OR9G1Q8NH87 305 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 JOSD2Q8TAC2 188 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 LRRC45Q96CN5 670 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 HAUS1Q96CS2 278 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 SNF8Q96H20 258 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CPB2Q96IY4 423 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 MCEEQ96PE7 176 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 PEBP4Q96S96 227 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 SELENOSQ9BQE4 189 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 NAT9Q9BTE0 207 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 FAM107BQ9H098 131 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 DEFB127Q9H1M4 99 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CXCL16Q9H2A7 254 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 SRMSQ9H3Y6 488 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 LRRC19Q9H756 370 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 NTN4Q9HB63 628 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 FANCEQ9HB96 536 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CHRAC1Q9NRG0 131 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 KIAA1257Q9ULG3 409 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 FLNCQ14315 2725 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 SHROOM3Q8TF72 1996 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 PATJQ8NI35 1801 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa2.12□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 NOTCH1P46531 2555 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 MYLKQ15746 1914 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 PSMB11A5LHX3 300 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 GMNCA6NCL1 334 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 GOLGA6L10A6NI86 522 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 F8VP50 259 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 J3QKU1 62 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 EMC8O43402 210 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 HCRTO43612 131 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CHST1O43916 411 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CLPXO76031 633 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 LSM8O95777 96 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 FAM107AO95990 144 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CSF3P09919 207 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 GKN3PP0CG01 181 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CHTF8P0CG12 524 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 STAG3L3P0CL85 134 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CD1EP15812 388 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 MSR1P21757 451 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 WARSP23381 471 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 F2RP25116 425 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 STOMP27105 288 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 SERPINB5P36952 375 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 CDKN2BP42772 138 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 GSSP48637 474 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 TMED10P49755 219 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 DYNLT1P63172 113 aa2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
RBBP4-210ENST00000475321 PAX5Q02548 391 aa2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms