RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	NOX4	Q9NPH5	578 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PRO0628	Q9UI54	55 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RAB22A	Q9UL26	194 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SYNM	O15061	1565 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OVOS2	A0A0J9YW53	1432 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OVOS2	Q6IE36	1432 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398		A0A0G2JNG1	304 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MYADML2	A6NDP7	307 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR5H1	A6NKK0	313 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398		B5MCH6	92 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398		H3BTX0	84 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SLC17A3	O00476	420 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PRY	O14603	147 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MBTPS2	O43462	519 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	IGHG3	P01860	377 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	UBB	P0CG47	229 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GLI4	P10075	376 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	AZU1	P20160	251 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ACRV1	P26436	265 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PYCR1	P32322	319 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SULT1A1	P50225	295 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SULT1A2	P50226	295 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RAB25	P57735	213 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	HILS1	P60008	231 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RHOB	P62745	196 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SRY	Q05066	204 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	FMOD	Q06828	376 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	BAX	Q07812	192 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PLCXD2	Q0VAA5	305 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	KIR2DS5	Q14953	304 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	UPP1	Q16831	310 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	LTC4S	Q16873	150 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	UNC50	Q53HI1	259 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TREML2	Q5T2D2	321 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	WDR82	Q6UXN9	313 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	STRADA	Q7RTN6	431 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR2L13	Q8N349	312 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF614	Q8N883	585 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR4X1	Q8NH49	305 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF503	Q96F45	646 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF347	Q96SE7	839 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OPTC	Q9UBM4	332 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398		Q9UF83	564 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	AKAP12	Q02952	1782 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MED14	O60244	1454 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PTPRJ	Q12913	1337 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	FAAH	O00519	579 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MFNG	O00587	321 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SH2D1B	O14796	132 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	KLF8	O95600	359 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CDS2	O95674	445 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TFAP2A	P05549	437 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RAB3B	P20337	219 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	HTR1E	P28566	365 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZFP36L2	P47974	494 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CLINT1	Q14677	625 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SHH	Q15465	462 aa		2.78	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		2.78	□□□□□ -1.96

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