RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470115.1

GTF3C2-209, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 2, human

TSL 5

Gene GTF3C2, Length 653 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTF3C2-209	ENST00000470115	FAM20B	O75063	409 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	GLCE	O94923	617 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	CD200	P41217	278 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	MPPED2	Q15777	294 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	ATP6AP1	Q15904	470 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	ABHD6	Q9BV23	337 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	SLC22A4	Q9H015	551 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	MARCH7	Q9H992	704 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	MIOX	Q9UGB7	285 aa		13.73	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115		A8MXK9	166 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	TBX1	O43435	398 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	GMDS	O60547	372 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	FSHB	P01225	129 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	OSM	P13725	252 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	ANXA8	P13928	327 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	IRF2	P14316	349 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZNF12	P17014	697 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	SLC15A1	P46059	708 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	CX3CR1	P49238	355 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	RAD23A	P54725	363 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	CDK5	Q00535	292 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZNF154	Q13106	437 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	SHF	Q7M4L6	423 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	KLB	Q86Z14	1044 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	TIGD4	Q8IY51	512 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115		Q8TCH9	128 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	ERGIC1	Q969X5	290 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	AMELY	Q99218	206 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	SLC6A7	Q99884	636 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	S100A14	Q9HCY8	104 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.72	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	XRCC2	O43543	280 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	FSTL3	O95633	263 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	BAG2	O95816	211 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	HMGN1	P05114	100 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	HSD11B1	P28845	292 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZNF404	Q494X3	552 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	USP43	Q70EL4	1123 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	CPO	Q8IVL8	374 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	TOR3A	Q9H497	397 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		13.71	□□□□□ -0.21
GTF3C2-209	ENST00000470115	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115		G3V2T6	193 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115		H3BNX3	289 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	SELENOF	O60613	162 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	CPT2	P23786	658 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	CD80	P33681	288 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	OPRL1	P41146	370 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	HILS1	P60008	231 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	TIGD6	Q17RP2	521 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	KLHL12	Q53G59	568 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	THEM6	Q8WUY1	208 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	SGK3	Q96BR1	496 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	PKP2	Q99959	881 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	OPA3	Q9H6K4	179 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	SP140L	Q9H930	580 aa		13.7	□□□□□ -0.22
GTF3C2-209	ENST00000470115	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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