RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469307.4

PGAP2-215, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 3

Gene PGAP2, Length 798 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-215	ENST00000469307	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	GIPC3	Q8TF64	312 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	MRI1	Q9BV20	369 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	CHID1	Q9BWS9	393 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	SP140L	Q9H930	580 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	RNF7	Q9UBF6	113 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		10.3	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	LGALS8	O00214	317 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	PRODH	O43272	600 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	SOX14	O95416	240 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	CLU	P10909	449 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	CA6	P23280	308 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	PRTN3	P24158	256 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	OPRL1	P41146	370 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	PITPNB	P48739	271 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	MZT1	Q08AG7	82 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	PPP1R8	Q12972	351 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	OR8G1	Q15617	311 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	MPPED2	Q15777	294 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	KCNJ8	Q15842	424 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	SHF	Q7M4L6	423 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	OR8B2	Q96RD0	313 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	COPS4	Q9BT78	406 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	ABHD6	Q9BV23	337 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	RGCC	Q9H4X1	137 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF69	Q9UC07	566 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307		U3KQV3	271 aa		10.29	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	DYNC1I1	O14576	645 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	CST1	P01037	141 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	GYPB	P06028	91 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	LIPF	P07098	398 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	SPARC	P09486	303 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	HKR1	P10072	659 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	IRF2	P14316	349 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	GSTT1	P30711	240 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	GNB2	P62879	340 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM3A	P98173	230 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	CDK5	Q00535	292 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	OR8B8	Q15620	311 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	KLHL12	Q53G59	568 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	C12orf54	Q6X4T0	127 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	NRBF2	Q96F24	287 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	INTS14	Q96SY0	518 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	CLN8	Q9UBY8	286 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		10.28	□□□□□ -0.76
PGAP2-215	ENST00000469307	GGT3P	A6NGU5	568 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	C22orf46	C9J442	243 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	TIPRL	O75663	272 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	HMGN1	P05114	100 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	OSM	P13725	252 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	ANXA8	P13928	327 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	MMP9	P14780	707 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC2A5	P22732	501 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	PRKX	P51817	358 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	PRSS12	P56730	875 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	ACTG1	P63261	375 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	SNCB	Q16143	134 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	FAM201A	Q5SY85	155 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	CD276	Q5ZPR3	534 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		10.27	□□□□□ -0.77
PGAP2-215	ENST00000469307	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		10.27	□□□□□ -0.77

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