RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 HLA-HP01893 362 aa6.88□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 CALCBP10092 127 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CD59P13987 128 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 CBR1P16152 277 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MAKP20794 623 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ARL3P36405 182 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.88□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 OR4N2Q8NGD1 307 aa6.88□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 KIR2DL3P43628 341 aa6.87□□□□□ -1.31
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USP54-210ENST00000466048 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.87□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 MARCH3Q86UD3 253 aa6.87□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZNF695Q8IW36 515 aa6.87□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.87□□□□□ -1.31
USP54-210ENST00000466048 LIPHQ8WWY8 451 aa6.87□□□□□ -1.31
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