RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 FN3KRPQ9HA64 309 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ERVK-18Q9QC07 812 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 LEUTXA8MZ59 168 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 FCER2P06734 321 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ADRA2AP08913 450 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 MTCP1P56278 107 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM185AQ8NFB2 350 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 SLC1A7O00341 560 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 HTR3BO95264 441 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 C1QCP02747 245 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CLPSP04118 112 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 HLA-DPB1P04440 258 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 PTGDSP41222 190 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 FNDC7Q5VTL7 733 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 C10orf111Q8N326 155 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM203Q969S6 136 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM45BQ96B21 275 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 FAM118AQ9NWS6 357 aa8.13□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 HIVEP2P31629 2446 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 MEGF11A6BM72 1044 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 METTL21EPA6NDL7 271 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 TOR1AO14656 332 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 SYNGR3O43761 229 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CCL8P80075 99 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 XAF1Q6GPH4 301 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 SIAH3Q8IW03 269 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 PTP4A1Q93096 173 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 C7orf34Q96L11 122 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 MUS81Q96NY9 551 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 TMED9Q9BVK6 235 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 LINC00470Q9BZP3 86 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF442Q9H7R0 627 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ABCB9Q9NP78 766 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 KCNIP1Q9NZI2 227 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 SCN8AQ9UQD0 1980 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 DSPPQ9NZW4 1301 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF292O60281 2723 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 SELENOFO60613 162 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 UPK1BO75841 260 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CRYBA1P05813 215 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ST6GAL2Q96JF0 529 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 TEAD3Q99594 435 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 KCNJ15Q99712 375 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 FER1L5A0AVI2 2057 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ST8SIA5O15466 376 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 RAMP1O60894 148 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ENTPD6O75354 484 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 PRSS23O95084 383 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 RAB3AP20336 220 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV1-2P23083 117 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 EDDM3BP56851 147 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 MVKQ03426 396 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CMTM4Q8IZR5 234 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 FAM71CQ8NEG0 241 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF519Q8TB69 540 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 NDNFQ8TB73 568 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CA10Q9NS85 328 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ACOXLQ9NUZ1 547 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 IL20Q9NYY1 176 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.12□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 TSC22D2O75157 780 aa8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 NAAAQ02083 359 aa8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF773Q6PK81 442 aa8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A40Q8TBP6 338 aa8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 SLC7A6Q92536 515 aa8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 REEP6Q96HR9 211 aa8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ABHD6Q9BV23 337 aa8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 RGCCQ9H4X1 137 aa8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 NRIP3Q9NQ35 241 aa8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 PIGLQ9Y2B2 252 aa8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 C5orf42Q9H799 3197 aa8.11□□□□□ -1.11
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF250P15622 560 aa8.11□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms