RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460731.5

PTPN12-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 12, human

TSL 2

Gene PTPN12, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN12-209	ENST00000460731	WNT5A	P41221	380 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	EVX1	P49640	407 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RGS6	P49758	472 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	HCCS	P53701	268 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	UCP2	P55851	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ACTC1	P68032	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ACTA1	P68133	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	TUBA1B	P68363	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	TUBA4A	P68366	448 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PIGF	Q07326	219 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ACSM1	Q08AH1	577 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ST3GAL4	Q11206	333 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	MED21	Q13503	144 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RAB39A	Q14964	217 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OTP	Q5XKR4	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	DRAM2	Q6UX65	266 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SSX6	Q7RTT6	188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ATF6B	Q99941	703 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	RERGL	Q9H628	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	AMBN	Q9NP70	447 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTPN12-209	ENST00000460731	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731		A0A0U1RQV5	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731		A0A1W2PR80	420 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	METTL15	A6NJ78	407 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	CASK	O14936	926 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	OGG1	O15527	345 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	DOK2	O60496	412 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	RAB36	O95755	333 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	PNP	P00491	289 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	CRYAA	P02489	173 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	CD1A	P06126	327 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	SPARC	P09486	303 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	NAA10	P41227	235 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	RAD52	P43351	418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	CAPZA2	P47755	286 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	TGM4	P49221	684 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	ETV1	P50549	477 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF83	P51522	516 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	CCR9	P51686	369 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	GABARAPL2	P60520	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	EFNB3	Q15768	340 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	CCDC58	Q4VC31	144 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	LIPN	Q5VXI9	398 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTPN12-209	ENST00000460731	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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