RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPRR3Q9UBC9 169 aa15.23■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATPIF1Q9UII2 106 aa15.23■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF391Q9UJN7 358 aa15.23■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF175Q9Y473 711 aa15.23■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CSAG2Q9Y5P2 127 aa15.23■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GIFP27352 417 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRSS3P35030 304 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAUP35544 74 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PSG4Q00888 419 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AWAT2Q6E213 333 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RAB12Q6IQ22 244 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF100Q8IYN0 542 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AKR7LQ8NHP1 331 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KLK11Q9UBX7 282 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF221Q9UK13 617 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ALG5Q9Y673 324 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 A0A0B4J293 547 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC22A20A6NK97 555 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DHRS7CA6NNS2 312 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SULT1C2O00338 296 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KDM4BO94953 1096 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MT-ND4P03905 459 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TCRBP04435 133 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PMPCAQ10713 525 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF627Q7L945 461 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR5AS1Q8N127 324 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WNT5BQ9H1J7 359 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HRASLSQ9HDD0 168 aa15.22■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 E9PLN8 166 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 H7C417 338 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CEACAM4O75871 244 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IGHG3P01860 377 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CSF1P09603 554 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANOS1P23352 680 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARF1P84077 181 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PMP22Q01453 160 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OLFML2AQ68BL7 652 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLXDC2Q6UX71 529 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UTS2BQ765I0 119 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM46BQ96A09 425 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ACTR6Q9GZN1 396 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUDT15Q9NV35 164 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FBLN5Q9UBX5 448 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MTFP1Q9UDX5 166 aa15.21■□□□□ 0.03
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ALX3O95076 343 aa15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LCATP04180 440 aa15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PTHLHP12272 177 aa15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM189A2Q15884 450 aa15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SFRP5Q5T4F7 317 aa15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ASCL5Q7RTU5 278 aa15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR2W3Q7Z3T1 314 aa15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GPER1Q99527 375 aa15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHST5Q9GZS9 411 aa15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RGCCQ9H4X1 137 aa15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SCPEP1Q9HB40 452 aa15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KCNMB2Q9Y691 235 aa15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF407Q9C0G0 2248 aa15.21■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PATE4P0C8F1 98 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UBBP0CG47 229 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RAG2P55895 527 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ACTBP60709 375 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ACTG1P63261 375 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SNAI3Q3KNW1 292 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BIVMQ86UB2 503 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDH24Q86UP0 819 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANGPTL5Q86XS5 388 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PIGLQ9Y2B2 252 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DNAJC13O75165 2243 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FREM2Q5SZK8 3169 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C5orf63A6NC05 138 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TBRG1Q3YBR2 411 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 BTN2A1Q7KYR7 527 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 P4HA3Q7Z4N8 544 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF101Q8IZC7 436 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR6F1Q8NGZ6 308 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SGK3Q96BR1 496 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 REEP6Q96HR9 211 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NEK6Q9HC98 313 aa15.2■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRF1P14222 555 aa15.19■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PCGF3Q3KNV8 242 aa15.19■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa15.19■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR10K2Q6IF99 312 aa15.19■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PRDM14Q9GZV8 571 aa15.19■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRAV6A0A075B6T7 132 aa15.18■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 LPLP06858 475 aa15.18■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAHP16930 419 aa15.18■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AGTR1P30556 359 aa15.18■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCR6P51684 374 aa15.18■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa15.18■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZADH2Q8N4Q0 377 aa15.18■□□□□ 0.02
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OR56B4Q8NH76 319 aa15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118 ms