RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	SLC35A1	P78382	337 aa		14.96	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF345	Q14585	488 aa		14.96	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PCOLCE	Q15113	449 aa		14.96	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		14.96	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		14.96	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM104	Q8NE00	496 aa		14.96	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	LINC00052	Q96N35	136 aa		14.96	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	WDR54	Q9H977	334 aa		14.96	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		14.96	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF726	A6NNF4	738 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SULT2B1	O00204	365 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SPDEF	O95238	335 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	COMMD2	Q86X83	199 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CCS	O14618	274 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TP53I11	O14683	189 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	EFS	O43281	561 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FGF2	P09038	288 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	UBB	P0CG47	229 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FGF5	P12034	268 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CTSS	P25774	331 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR3A4P	P47883	348 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	DOK3	Q7L591	496 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ST8SIA4	Q92187	359 aa		14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CDC14B	O60729	498 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR2F2	O95006	317 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	IL13RA1	P78552	427 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	H3F3A	P84243	136 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR2F1	Q13607	317 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SMUG1	Q53HV7	270 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	GTPBP8	Q8N3Z3	284 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ST8SIA2	Q92186	375 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PHB2	Q99623	299 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PRO3102	Q9H379	93 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	COMMD9	Q9P000	198 aa		14.94	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058		A0A087WZY1	265 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NUP62	P37198	522 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	FAM57B	Q71RH2	274 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NAA40	Q86UY6	237 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	HOGA1	Q86XE5	327 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	EIF4E3	Q8N5X7	224 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NAT6	Q93015	286 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SEC22A	Q96IW7	307 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	SOCS1	O15524	211 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	MPIG6B	O95866	241 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	HP	P00738	406 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PMP2	P02689	132 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	IFNA6	P05013	189 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CLDN17	P56750	224 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	HLA-B	Q31612	363 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	OR4K15	Q8NH41	348 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	PPP1R1C	Q8WVI7	109 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	HLA-C	Q95604	372 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	RAB3C	Q96E17	227 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058		E9PLN8	166 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	IGLV3-1	P01715	115 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	CELA2A	P08217	269 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	ATP1B3	P54709	279 aa		14.92	□□□□□ -0.02
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM50B	P56557	158 aa		14.92	□□□□□ -0.02

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