RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 DNLZQ5SXM8 178 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF20Q5VT98 475 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ACOT4Q8N9L9 421 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NUP43Q8NFH3 380 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8WTZ3 238 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NKD1Q969G9 470 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 INTS14Q96SY0 518 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TWSG1Q9GZX9 223 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 KLK13Q9UKR3 277 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 STARD10Q9Y365 291 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 MED31Q9Y3C7 131 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 EML5Q05BV3 1969 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ALPK2Q86TB3 2170 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A087WZY1 265 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF724A8MTY0 619 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 C2CD4DB7Z1M9 353 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 PROB1E7EW31 1015 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF7P21781 194 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SSR2P43308 183 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CDKN1BP46527 198 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 S100A10P60903 97 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR137CQ8N3F9 429 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2AP1Q8NGE2 309 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 OR52E1Q8NGJ3 308 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5R1Q8NH85 324 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NGBQ9NPG2 151 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TAC3Q9UHF0 121 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SPACA6W5XKT8 324 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NPIPA7E9PJI5 369 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CYB5BO43169 146 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFS4O43181 175 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 LEFTY1O75610 366 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 STK17BO94768 372 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NPIPA8P0DM63 369 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS54Q6PEW0 395 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 C17orf64Q86WR6 236 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF584Q8IVC4 421 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC16A11Q8NCK7 471 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ZPLD1Q8TCW7 415 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 CDS1Q92903 461 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TNFRSF14Q92956 283 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35A4Q96G79 324 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NMNAT3Q96T66 252 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 MACROD1Q9BQ69 325 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 NMES1Q9C002 83 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM160Q9NX00 188 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 IL17BQ9UHF5 180 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR45Q9Y484 360 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SCN2AQ99250 2005 aa7.51□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 A6NNC1 897 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 C9J4A7 227 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 DLEU1O43261 78 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 EFSO43281 561 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 OPN1LWP04000 364 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 F13BP05160 661 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 TRGC1P0CF51 173 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC6A6P31641 620 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP3K8P41279 467 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 FHITP49789 147 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC10A1Q14973 349 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB11BQ15907 218 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 ELOA3BQ3SY89 546 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa7.5□□□□□ -1.21
RABGEF1-203ENST00000439720 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms