RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379018.7

PDLIM4-202, Transcript of PDZ and LIM domain 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDLIM4, Length 1,006 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM4-202ENST00000379018 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.62□□□□□ -0.07
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PDLIM4-202ENST00000379018 BBIP1A8MTZ0 92 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 M0R135 149 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 NDUFA2O43678 99 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 RENP00797 406 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
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PDLIM4-202ENST00000379018 IKZF1Q13422 519 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.62□□□□□ -0.07
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PDLIM4-202ENST00000379018 ZNF799Q96GE5 643 aa14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 SLC22A4Q9H015 551 aa14.62□□□□□ -0.07
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PDLIM4-202ENST00000379018 CMTM6Q9NX76 183 aa14.61□□□□□ -0.07
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PDLIM4-202ENST00000379018 OPN1MWP04001 364 aa14.6□□□□□ -0.07
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PDLIM4-202ENST00000379018 ITPKCQ96DU7 683 aa14.6□□□□□ -0.07
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PDLIM4-202ENST00000379018 NOTCH3Q9UM47 2321 aa14.6□□□□□ -0.07
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PDLIM4-202ENST00000379018 OR8S1Q8NH09 359 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 SPTSSAQ969W0 71 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 SEH1LQ96EE3 360 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 MAP6Q96JE9 813 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 SIKE1Q9BRV8 207 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PDLIM4-202ENST00000379018 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
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