RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 SPNP16150 400 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 FAHP16930 419 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TALDO1P37837 337 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 PITPNBP48739 271 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OXA1LQ15070 435 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 RAB11BQ15907 218 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TBRG1Q3YBR2 411 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 KRTCAP3Q53RY4 240 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 BIVMQ86UB2 503 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 NAXEQ8NCW5 288 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OR4D6Q8NGJ1 314 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OR52H1Q8NGJ2 320 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 FAM3DQ96BQ1 224 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 STARD4Q96DR4 205 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 REEP6Q96HR9 211 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 WACQ9BTA9 647 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 PIGLQ9Y2B2 252 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 V9GYS6 101 aa13.35□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 MEGF11A6BM72 1044 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 LANCL1O43813 399 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 SSX4O60224 188 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 DHRS3O75911 302 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 EDN3P14138 238 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 RAB3AP20336 220 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ACKR3P25106 362 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 STOMP27105 288 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 HTR2CP28335 458 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 POU3F4P49335 361 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 PER3P56645 1201 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TNK1Q13470 666 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 MTFR2Q6P444 385 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OR5AS1Q8N127 324 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF610Q8N9Z0 462 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ZFP3Q96NJ6 502 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 CNTD2Q9H8S5 307 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa13.34□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ISPDA4D126 451 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TTLL8A6PVC2 850 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ARR3P36575 388 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TDGF1P3P51864 188 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 UCNP55089 124 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF92Q03936 586 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 RIN1Q13671 783 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 UBE2V2Q15819 145 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TRIM16LQ309B1 348 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OR2A2Q6IF42 318 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OR10K2Q6IF99 312 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 MDP1Q86V88 176 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 PLEKHA1Q9HB21 404 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM138Q9NPI0 162 aa13.33□□□□□ -0.27
CASQ1-201ENST00000368078 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 CGAP01215 116 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 PTHLHP12272 177 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ART1P52961 327 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 C1orf100Q5SVJ3 147 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM53Q6P2H8 277 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 Q6ZSR3 168 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 Q6ZT83 130 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 GDPD3Q7L5L3 318 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 OR6K3Q8NGY3 331 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 NPRL2Q8WTW4 380 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 CMTM3Q96MX0 182 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF75AQ96N20 296 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa13.33□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 CIB4A0PJX0 185 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 SULT1B1O43704 296 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 NGFP01138 241 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 CDK2P24941 298 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 CFPP27918 469 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 GABRA6Q16445 453 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 GSG1Q2KHT4 349 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 C1orf185Q5T7R7 199 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 FAM57AQ8TBR7 257 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 POM121L2Q96KW2 1035 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 GAL3ST1Q99999 423 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ABCG5Q9H222 651 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 ASF1BQ9NVP2 202 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 RHBDL2Q9NX52 303 aa13.32□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 PLA2G10O15496 165 aa13.31□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 WDR1O75083 606 aa13.31□□□□□ -0.28
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM127O75204 238 aa13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms