RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000363574.1

RNU6-1339P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1339, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1339P, Length 91 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1339P-201ENST00000363574 A0A0A6YYD5 115 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 E7EWF7 191 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 K7EN84 100 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ANGPTL7O43827 346 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SC5DO75845 299 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PTTG1O95997 202 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RHOCP08134 193 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GNRHRP30968 328 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GGT2P36268 569 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TAS2R46P59540 309 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MADCAM1Q13477 382 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C2orf83Q53S99 150 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TFDP3Q5H9I0 405 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MKXQ8IYA7 352 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR6N2Q8NGY6 317 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TMEM234Q8WY98 164 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CPB2Q96IY4 423 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CEP170P1Q96L14 293 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FAM19A4Q96LR4 140 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GABRG3Q99928 467 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IFI27L2Q9H2X8 130 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR51B5Q9H339 312 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ASB8Q9H765 288 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TREM1Q9NP99 234 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 A0A096LNJ9 63 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TVP23AA6NH52 213 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RAD1O60671 282 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ALOX12BO75342 701 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SMC2O95347 1197 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PSG2P11465 335 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 HTR1DP28221 377 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TAS2R60P59551 318 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RAP1AP62834 184 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IFFO1Q0D2I5 559 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ST3GAL4Q11206 333 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR1Q1Q15612 314 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TNXAQ16473 311 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TAL2Q16559 108 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TCEAL5Q5H9L2 206 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FBXW9Q5XUX1 488 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 COPS6Q7L5N1 327 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SLC30A8Q8IWU4 369 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LGALS14Q8TCE9 139 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CDKL2Q92772 493 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TCEAL3Q969E4 200 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TEAD3Q99594 435 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KCNS3Q9BQ31 491 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TPK1Q9H3S4 243 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TREX1Q9NSU2 369 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 WSB1Q9Y6I7 421 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SEC14L6B5MCN3 397 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LINC01619G3V211 115 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 H0Y9J4 135 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZMPSTE24O75844 475 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 IGHV1-8P0DP01 117 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MDKP21741 143 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 DTYMKP23919 212 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LOXP28300 417 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ARR3P36575 388 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 KCNJ3P48549 501 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 GFERP55789 205 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MLF1P58340 268 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 RPL23P62829 140 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 XRCC4Q13426 336 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PSG3Q16557 428 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 Q6ZVH6 145 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 LINC00469Q8N7U9 141 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 UBAC2Q8NBM4 344 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C19orf18Q8NEA5 215 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR10G6Q8NH81 332 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C15orf40Q8WUR7 153 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 PTX4Q96A99 478 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ARV1Q9H2C2 271 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 C12orf10Q9HB07 376 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 VCX3AQ9NNX9 186 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ANAPC11Q9NYG5 84 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 OR12D3Q9UGF7 316 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CLEC2DQ9UHP7 191 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 CELA1Q9UNI1 258 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 POFUT2Q9Y2G5 429 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 SIGLEC9Q9Y336 463 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1339P-201ENST00000363574 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms