RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 FAM189A2Q15884 450 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 COMMD2Q86X83 199 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 TERB2Q8NHR7 220 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 KCNG3Q8TAE7 436 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 RAB3CQ96E17 227 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 SHISA8B8ZZ34 492 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 SERPINF1P36955 418 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 MICBQ29980 383 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PLPPR5Q32ZL2 321 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM128Q5BJH2 165 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 NAA40Q86UY6 237 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 OR5AS1Q8N127 324 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 MARC2Q969Z3 335 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PIK3IP1Q96FE7 263 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PCDHB10Q9UN67 800 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CSAG2Q9Y5P2 127 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 SPAG17Q6Q759 2223 aa16.16■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0A6YYD4 124 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CEACAM18A8MTB9 384 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 F8VVB4 439 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 F8VWA3 439 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CDC14BO60729 498 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 MPIG6BO95866 241 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 HEXBP07686 556 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 SRFP11831 508 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 TPT1P13693 172 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 RTN4RL2Q86UN3 420 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 OR5AP2Q8NGF4 316 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 OR8B12Q8NGG6 310 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM59Q9BXS4 323 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 SLC6A15Q9H2J7 730 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 SEC61A2Q9H9S3 476 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 SDHAF3Q9NRP4 125 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 EFNA2O43921 213 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 BCKDHBP21953 392 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 PLAC9Q5JTB6 97 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 RABEPKQ7Z6M1 372 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 CLRN3Q8NCR9 226 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM104Q8NE00 496 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 DCUN1D4Q92564 292 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM41AQ96HV5 264 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 ASF1BQ9NVP2 202 aa16.15■□□□□ 0.18
SPNS3-201ENST00000355530 UNC13CQ8NB66 2214 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ASXL3Q9C0F0 2248 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 PGAM2P15259 253 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ABOP16442 354 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OR3A4PP47883 348 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 GABREP78334 506 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 NAAAQ02083 359 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 COL19A1Q14993 1142 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC157Q569K6 752 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OR1S2Q8NGQ3 325 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OR2I1PQ8NGU4 316 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SPACA5Q96QH8 159 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 MESP1Q9BRJ9 268 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF416Q9BWM5 594 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 GPR84Q9NQS5 396 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 EYSQ5T1H1 3165 aa16.14■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 FGF16O43320 207 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 CCL1P22362 96 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SLC30A7Q8NEW0 376 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OR5T2Q8NGG2 359 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OR56B1Q8NGI3 324 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 OR5L2Q8NGL0 311 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 POC1BQ8TC44 478 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 WIF1Q9Y5W5 379 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 CEP192Q8TEP8 1941 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 A0A0B4J2A0 478 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SIGLEC5O15389 551 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 HCKP08631 526 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 CBX5P45973 191 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 P2RY4P51582 365 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 RNF144BQ7Z419 303 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ARMC10Q8N2F6 343 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 SCGB3A2Q96PL1 93 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 C5orf66Q9H5L9 145 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 RAB18Q9NP72 206 aa16.13■□□□□ 0.17
SPNS3-201ENST00000355530 ASH2LQ9UBL3 628 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms