RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 OPA3Q9H6K4 179 aa23.69■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PTTG3PQ9NZH4 202 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF462Q96JM2 2506 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 CASKO14936 926 aa23.69■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CCL1P22362 96 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1CBP62140 327 aa23.69■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXB2Q5VYV0 432 aa23.69■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf174Q8IYL3 243 aa23.69■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM106AQ96A25 262 aa23.69■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 BCL2L14Q9BZR8 327 aa23.69■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A1O15245 554 aa23.68■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SPSB4Q96A44 273 aa23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 DACH2Q96NX9 599 aa23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOX4Q9NPH5 578 aa23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 TUBG2Q9NRH3 451 aa23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 CALRP27797 417 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLPP7Q8NBV4 271 aa23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF167Q9H6Y7 350 aa23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 CKLFQ9UBR5 152 aa23.66■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 UCHL1P09936 223 aa23.65■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM27D1Q5T7N8 215 aa23.65■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 USP43Q70EL4 1123 aa23.65■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GGT3PA6NGU5 568 aa23.64■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINB10P48595 397 aa23.64■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSK3AP49840 483 aa23.64■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM3AP98173 230 aa23.64■■□□□ 1.38
CTDNEP1-201ENST00000318988 BSPH1Q075Z2 132 aa23.64■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR14K1Q8NGZ2 314 aa23.64■■□□□ 1.38
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa23.64■■□□□ 1.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ABCD4O14678 606 aa23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa23.64■■□□□ 1.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A40Q8TBP6 338 aa23.64■■□□□ 1.37
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2J1Q9GZK6 312 aa23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 POFUT1Q9H488 388 aa23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIGLQ9Y2B2 252 aa23.64■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 TGFBR1P36897 503 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 KIR2DL3P43628 341 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS23P62266 143 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A25Q6T423 547 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 C10orf35Q96D05 121 aa23.63■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 LMX1BO60663 402 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 BEX5Q5H9J7 111 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 Q6ZSR3 168 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5D14Q8NGL3 314 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 NDNFQ8TB73 568 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PLPPR2Q96GM1 343 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 DCSTAMPQ9H295 470 aa23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
CTDNEP1-201ENST00000318988 A6NIN4 97 aa23.61■■□□□ 1.37
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