RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 J3QLW9 94 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 TTRP02766 147 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 MT-ND5P03915 603 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 SELEP16581 610 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF19P17023 458 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 DNASE1P24855 282 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 LIPAP38571 399 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 MMP15P51511 669 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 GABARAPL2P60520 117 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 FAM3AP98173 230 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 BCL2L15Q5TBC7 163 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 OR2G6Q5TZ20 316 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CDH24Q86UP0 819 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 KLHL36Q8N4N3 616 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF485Q8NCK3 441 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 SGCDQ92629 289 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 REEP6Q96HR9 211 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CDCA4Q9BXL8 241 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CACNG6Q9BXT2 260 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CYSLTR2Q9NS75 346 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 TAAR3PQ9P1P4 343 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CLEC2DQ9UHP7 191 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 PDZD2O15018 2839 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CSMD2Q7Z408 3487 aa11.31□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 HTR1AP08908 422 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CDKN1AP38936 164 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 PSMB10P40306 273 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 TGM4P49221 684 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CCR9P51686 369 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 IRF3Q14653 427 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 OR8B8Q15620 311 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 NKPD1Q17RQ9 610 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ALKBH6Q3KRA9 238 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ZMAT1Q5H9K5 638 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 WDR38Q5JTN6 314 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 OR2T2Q6IF00 324 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS35Q8N3Z0 413 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 OR2G2Q8NGZ5 317 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R14AQ96A00 147 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 LYZL4Q96KX0 146 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 GSX2Q9BZM3 304 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 MS4A5Q9H3V2 200 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 DYNLRB1Q9NP97 96 aa11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1B0GWJ7 208 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 PLSCR5A0PG75 271 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CD300LBA8K4G0 201 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 MYL12BO14950 172 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 RGS10O43665 173 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ADH4P08319 380 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ATP6V1B1P15313 513 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CCL1P22362 96 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 DDOSTP39656 456 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ALDH3B1P43353 468 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 KIR3DL2P43630 455 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 TNK1Q13470 666 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC58Q4VC31 144 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 Q6ZSR3 168 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS48Q7RTY5 328 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 NANOGP1Q8N7R0 232 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 PLPP7Q8NBV4 271 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 OR8G5Q8NG78 346 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 RPS4Y2Q8TD47 263 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 GPR84Q9NQS5 396 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 FRRS1LQ9P0K9 344 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ERVK-18Q9QC07 812 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 SLC22A13Q9Y226 551 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ERGIC3Q9Y282 383 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC168Q8NDH2 2452 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 TANC2Q9HCD6 1990 aa11.29□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1B0GTI1 187 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 GGT3PA6NGU5 568 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 C17orf100A8MU93 164 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 E9PI62 339 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 NAT2P11245 290 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 GSK3AP49840 483 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 WNT4P56705 351 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 PRSS12P56730 875 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 GFOD2Q3B7J2 385 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 KRT74Q7RTS7 529 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 OR56B2PQ8NGI1 322 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 OR51E1Q8TCB6 317 aa11.28□□□□□ -0.6
CCDC42-201ENST00000293845 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms