RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282344.10

USP12-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP12, Length 4,511 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12-201ENST00000282344 AKR1C3P42330 323 aa19.53■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 CST9LP1Q5W188 147 aa19.53■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 SCMH1Q96GD3 660 aa19.53■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 ARID2Q68CP9 1835 aa19.53■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 ZNF831Q5JPB2 1677 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 SCN2AQ99250 2005 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 HSD17B6O14756 317 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 TAAR5O14804 337 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 PLA1AQ53H76 456 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 PPP1R35Q8TAP8 253 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 ICE1Q9Y2F5 2266 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 WNT11O96014 354 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 RAB31Q13636 194 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 DPPA2Q7Z7J5 298 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 EDAQ92838 391 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 LRP3O75074 770 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 TCN2P20062 427 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 ZNF141Q15928 474 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 TMEM100Q9NV29 134 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 FRRS1LQ9P0K9 344 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 NTMQ9P121 344 aa19.52■□□□□ 0.72
USP12-201ENST00000282344 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa19.52■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 H2AFB1P0C5Y9 115 aa19.52■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 OR2W3Q7Z3T1 314 aa19.52■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 CLRN3Q8NCR9 226 aa19.52■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 OR1N1Q8NGS0 311 aa19.52■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 C10orf90Q96M02 699 aa19.52■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 FOXQ1Q9C009 403 aa19.52■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 ZNF814B7Z6K7 855 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 HBG1P69891 147 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 HBG2P69892 147 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 PLXDC2Q6UX71 529 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 GVQW1Q8N7I0 195 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 TET1Q8NFU7 2136 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 ZNF724A8MTY0 619 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 UMAD1C9J7I0 102 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 DUSP1P28562 367 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 KIRREL1Q96J84 757 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 OXGR1Q96P68 337 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 FN3KRPQ9HA64 309 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 TUSC2O75896 110 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 LIMS1P48059 325 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 CES1P1Q9UKY3 287 aa19.51■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 LMO7DNF2Z398 122 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 PIGPP57054 158 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 HAGHQ16775 308 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 SPRED2Q7Z698 418 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 TMEM52Q8NDY8 209 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 MRGPRX4Q96LA9 322 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 CXorf58Q96LI9 332 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 CD37P11049 281 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 DTWD2Q8NBA8 298 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 AQP8O94778 261 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 RRASP10301 218 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 TAS2R30P59541 319 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 RAB11AP62491 216 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 SHBQ15464 509 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 TMEM268Q5VZI3 342 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 TMEM92Q6UXU6 159 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 ARRDC1Q8N5I2 433 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 DSPPQ9NZW4 1301 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 TSTD3H0UI37 97 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 RDH5Q92781 318 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 VSTM2LQ96N03 204 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 MAGT1Q9H0U3 335 aa19.5■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 HS3ST1O14792 307 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 ACTL6BO94805 426 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 SP6Q3SY56 376 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 ADGRG3Q86Y34 549 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 PLK3Q9H4B4 646 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 RER1O15258 196 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 FOXK1P85037 733 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 DEFA6Q01524 100 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 FZD2Q14332 565 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 OR8G2PQ6IF36 304 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 LINC00052Q96N35 136 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 VN1R1Q9GZP7 353 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 LILRA5A6NI73 299 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 DHHO43323 396 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 NXPH2O95156 264 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 OR52N4Q8NGI2 321 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 SIT1Q9Y3P8 196 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 ASXL3Q9C0F0 2248 aa19.49■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa19.48■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 ZNF587BE7ETH6 402 aa19.48■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 NRASP01111 189 aa19.48■□□□□ 0.71
USP12-201ENST00000282344 MYBPHQ13203 477 aa19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms