RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 UEVLDQ8IX04 471 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 ELP5Q8TE02 316 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 RNF133Q8WVZ7 376 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 RASL10BQ96S79 203 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 COL4A2P08572 1712 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GV50 99 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 SULT2B1O00204 365 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 CDK2AP1O14519 115 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 ZNF432O94892 652 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 IFNA6P05013 189 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 CCL3P10147 92 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 PGAM2P15259 253 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 PTGS2P35354 604 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 CX3CR1P49238 355 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 ARFRP1Q13795 201 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 PLPPR5Q32ZL2 321 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 RAET1LQ5VY80 246 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 FBXW5Q969U6 566 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 DEFB126Q9BYW3 111 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 POTEKPQ9BYX7 375 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.66□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 STMND1H3BQB6 276 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 ZNF43P17038 809 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 MPGP29372 298 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 OPRM1P35372 400 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 ACTBP60709 375 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 ACTG1P63261 375 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 TSPO2Q5TGU0 170 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 DNM1P46Q6ZS02 220 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 C6orf201Q7Z4U5 140 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 OR4K17Q8NGC6 315 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 OR4K15Q8NH41 348 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 PAQR8Q8TEZ7 354 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 TMEM234Q8WY98 164 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 DDIT4LQ96D03 193 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 SPSB2Q99619 263 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 C1orf198Q9H425 327 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 EVA1AQ9H8M9 152 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 TAS2R3Q9NYW6 316 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 C9orf170A2RU37 121 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 RNF222A6NCQ9 220 aa7.65□□□□□ -1.18
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GINS1-201ENST00000262460 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 RAB3AP20336 220 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 NTF4P34130 210 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 DCAF7P61962 342 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 SLC23A3Q6PIS1 610 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 OR5AS1Q8N127 324 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 TMED6Q8WW62 240 aa7.65□□□□□ -1.18
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GINS1-201ENST00000262460 CMTM3Q96MX0 182 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 CSAG2Q9Y5P2 127 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 AUP1Q9Y679 476 aa7.65□□□□□ -1.18
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 A0A1W2PQD3 144 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 TNFSF11O14788 317 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 PHYHO14832 338 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 ASCL1P50553 236 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 S100A10P60903 97 aa7.65□□□□□ -1.19
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GINS1-201ENST00000262460 DCDP81605 110 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 SP6Q3SY56 376 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 DRAM2Q6UX65 266 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 CDH26Q8IXH8 852 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 OR1S2Q8NGQ3 325 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 SCARB1Q8WTV0 552 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 DCUN1D4Q92564 292 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 FAM96BQ9Y3D0 163 aa7.65□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 MED13Q9UHV7 2174 aa7.64□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 METTL21EPA6NDL7 271 aa7.64□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 OR6C76A6NM76 312 aa7.64□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 B8ZZF3 427 aa7.64□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 H0YIZ8 118 aa7.64□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 GPR31O00270 319 aa7.64□□□□□ -1.19
GINS1-201ENST00000262460 SFTPBP07988 381 aa7.64□□□□□ -1.19
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