RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 GIMD1P0DJR0 217 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ST7LQ8TDW4 575 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RNF128Q8TEB7 428 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TCEAL3Q969E4 200 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SLAMF9Q96A28 289 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SLC19A3Q9BZV2 496 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SPACA1Q9HBV2 294 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 NPIPA1Q9UND3 350 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ASAH2BP0C7U1 165 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF141Q15928 474 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MICBQ29980 383 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SLC25A42Q86VD7 318 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 APCDD1LQ8NCL9 501 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RNF126Q9BV68 326 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RAB33BQ9H082 229 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MMP24Q9Y5R2 645 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TRANK1O15050 2925 aa14.94□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 VSIG8P0DPA2 414 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SLC25A1P53007 311 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 EGR3Q06889 387 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PLCXD2Q0VAA5 305 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PDCD1Q15116 288 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CLEC18BQ6UXF7 455 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 AKR7LQ8NHP1 331 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MITD1Q8WV92 249 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MRGPRFQ96AM1 343 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 C5orf67F2Z3F1 127 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 AHSA1O95433 338 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SERPINA2P20848 420 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 GPR3P46089 330 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SLC6A9P48067 706 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 UNC119Q13432 240 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RFNGQ9Y644 331 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 DOCK8Q8NF50 2099 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 A0A1W2PPE2 198 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 FOXS1O43638 330 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TSPAN15O95858 294 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OR3A4PP47883 348 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 NSDHLQ15738 373 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MFRPQ9BY79 579 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 DOCK7Q96N67 2140 aa14.93□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OMGP23515 440 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ABCD3P28288 659 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 HSD11B1P28845 292 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SKP2Q13309 424 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MEF2DQ14814 521 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 DHRS11Q6UWP2 260 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OR5H2Q8NGV7 314 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 A0A1B0GTI1 187 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SSX5O60225 188 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CD8AP01732 235 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CTAG1AP78358 180 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TLE1Q04724 770 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 EXD3Q8N9H8 876 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OR52N5Q8NH56 324 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RAB3CQ96E17 227 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF407Q9C0G0 2248 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 FRYQ5TBA9 3013 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MBTPS2O43462 519 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 GABRR1P24046 479 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 MECP2P51608 486 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 HNF4GQ14541 408 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 LRRC75AQ8NAA5 344 aa14.92□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 P4HA3Q7Z4N8 544 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 YIF1AO95070 293 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OPRM1P35372 400 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 TNFRSF4P43489 277 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 RPS10P46783 165 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OR51T1Q8NGJ9 327 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ELSPBP1Q96BH3 223 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 OBP2AQ9NY56 170 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 SVILO95425 2214 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 FAM221BA6H8Z2 402 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF44P15621 663 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 PGAP1Q75T13 922 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 WDFY1Q8IWB7 410 aa14.91□□□□□ -0.02
CTDP1-201ENST00000075430 C20orf196Q8IYI0 205 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.9 ms