RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638481.1

SPIN3-208, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 2,050 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-208	ENST00000638481	OR2A7	Q96R45	310 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	UCN2	Q96RP3	112 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		13.24	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	XRCC3	O43542	346 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	RBBP9	O75884	186 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ACSM4	P0C7M7	580 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CTRB1	P17538	263 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ADRA2C	P18825	462 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PTGS2	P35354	604 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	SUCLG1	P53597	346 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	BID	P55957	195 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	FMOD	Q06828	376 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	OXGR1	Q96P68	337 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	WDR76	Q9H967	626 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		13.23	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	TVP23A	A6NH52	213 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481		A6NIZ1	184 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC16A7	O60669	478 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CEACAM4	O75871	244 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CSF1	P09603	554 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CLDN15	P56746	228 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	RAP1B	P61224	184 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	RAP1A	P62834	184 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ETFDH	Q16134	617 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	GPR148	Q8TDV2	347 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ADGRG7	Q96K78	797 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	KCNK17	Q96T54	332 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	SLC6A15	Q9H2J7	730 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CA10	Q9NS85	328 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	B9D1	Q9UPM9	204 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ATM	Q13315	3056 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	MFSD2B	A6NFX1	497 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481		H7C417	338 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	ZNF43	P17038	809 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CXCL2	P19875	107 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	HYAL4	Q2M3T9	481 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	OTP	Q5XKR4	325 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	RDH8	Q9NYR8	311 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		13.22	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	B3GALNT1	O75752	331 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CFP	P27918	469 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	CALCR	P30988	508 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	RAC3	P60763	192 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	PPIA	P62937	165 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.29
SPIN3-208	ENST00000638481	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	CXCL13	O43927	109 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	MAS1	P04201	325 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	ITGB2	P05107	769 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	PTHLH	P12272	177 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	PMP22	Q01453	160 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	RNFT1	Q5M7Z0	435 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	OR10D3	Q8NH80	312 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	INTS14	Q96SY0	518 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481		A0A087WV48	116 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	HMSD	A8MTL9	139 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	RGS11	O94810	467 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	ALOX5AP	P20292	161 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	CENPA	P49450	140 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	LHX2	P50458	406 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	CARD18	P57730	90 aa		13.2	□□□□□ -0.3
SPIN3-208	ENST00000638481	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		13.2	□□□□□ -0.3

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