RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	EMX2	Q04743	252 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF33B	Q06732	778 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DUSP7	Q16829	419 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZS52	159 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SNX31	Q8N9S9	440 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR26	Q8NDV2	337 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NUBPL	Q8TB37	319 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	UCK2	Q9BZX2	261 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	UCK1	Q9HA47	277 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	AIG1	Q9NVV5	245 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXL12	Q9NXK8	326 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TAS2R16	Q9NYV7	291 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	STMN3	Q9NZ72	180 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OPTC	Q9UBM4	332 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF225	Q9UK10	706 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FADS3	Q9Y5Q0	445 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS21	Q9Y6M0	314 aa		4.13	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616		H0YJX3	145 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TXNDC9	O14530	226 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RFXANK	O14593	260 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	HSD17B6	O14756	317 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SURF4	O15260	269 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CXCL13	O43927	109 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RAMP1	O60894	148 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	STK16	O75716	305 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CCNB2	O95067	398 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ETHE1	O95571	254 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	HLA-H	P01893	362 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	HSD17B1	P14061	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TEAD1	P28347	426 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNA8	P32881	189 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CA5A	P35218	305 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ETV5	P41161	510 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	HSPA13	P48723	471 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SPINT3	P49223	89 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CX3CR1	P49238	355 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	AQP4	P55087	323 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SEMG2	Q02383	582 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	BNIP2	Q12982	314 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TWIST1	Q15672	202 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFA9	Q16795	377 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SBSN	Q6UWP8	590 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZSR9	355 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PPWD1	Q96BP3	646 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB3C	Q96E17	227 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DUS3L	Q96G46	650 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF514	Q96K75	400 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP3R2	Q96LZ3	170 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.12	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PQ72	361 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PRD5	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	FCN1	O00602	326 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	NME4	O00746	187 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10H3	O60404	316 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	EED	O75530	441 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	C8G	P07360	202 aa		4.11	□□□□□ -1.75
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75

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