RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636410.1

CHD2-224, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 2, human

TSL 5

Gene CHD2, Length 100 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD2-224	ENST00000636410	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	SLC1A7	O00341	560 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	TBX1	O43435	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	PNP	P00491	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	MT-ND5	P03915	603 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	TACSTD2	P09758	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	MYL12A	P19105	171 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	LIPA	P38571	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ALDH3B1	P43353	468 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	PTH2R	P49190	550 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	MMP15	P51511	669 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	OR12D2	P58182	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	CSNK2B	P67870	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ZNF92	Q03936	586 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	PSG7	Q13046	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	MED21	Q13503	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	GFOD2	Q3B7J2	385 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	LIPN	Q5VXI9	398 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	OR2T2	Q6IF00	324 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	AHSA2	Q719I0	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	SYS1	Q8N2H4	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	HAVCR2	Q8TDQ0	301 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	GGH	Q92820	318 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	SPSB4	Q96A44	273 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	PERP	Q96FX8	193 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	REEP6	Q96HR9	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	C4orf36	Q96KX1	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	FOXC2	Q99958	501 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ZNF649	Q9BS31	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	BRD7	Q9NPI1	651 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	SCN3B	Q9NY72	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	GNG8	Q9UK08	70 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410		R4GMQ9	66 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	CACNA1D	Q01668	2161 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	GGT3P	A6NGU5	568 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	C17orf100	A8MU93	164 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410		J3QLW9	94 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	IGLV3-1	P01715	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	TTR	P02766	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	CDK1	P06493	297 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ADH4	P08319	380 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	HTR1A	P08908	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ADRA2A	P08913	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	NAT2	P11245	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ZNF19	P17023	458 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ETV1	P50549	477 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ZNF81	P51508	661 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	CCR9	P51686	369 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	EFNA4	P52798	201 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ART1	P52961	327 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ATP5J2	P56134	94 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	PRSS12	P56730	875 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	SLC35A2	P78381	396 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	FAM3A	P98173	230 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CHD2-224	ENST00000636410	ST3GAL4	Q11206	333 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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