RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 STARD10Q9Y365 291 aa7.34□□□□□ -1.23
SGMS1-211ENST00000626236 A0A087WXM4 84 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 C5orf63A6NC05 138 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ACOD1A6NK06 481 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 GPRIN2O60269 458 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ATE1O95260 518 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 LALBAP00709 142 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 HSMCR30P0CW71 290 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ATP6V1B1P15313 513 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PCMT1P22061 227 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 THBS4P35443 961 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 KIR3DL2P43630 455 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1CBP62140 327 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 RPS23P62266 143 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MALLQ13021 153 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SPHARQ15513 63 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TIGD6Q17RP2 521 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 WDR38Q5JTN6 314 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 GLYATL3Q5SZD4 288 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 XAF1Q6GPH4 301 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF544Q6NX49 715 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD8Q6ZWB6 473 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF367Q7RTV3 350 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 COMMD2Q86X83 199 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 EGFL6Q8IUX8 553 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PRSS35Q8N3Z0 413 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZFP41Q8N8Y5 198 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF485Q8NCK3 441 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 NUP37Q8NFH4 326 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR52H1Q8NGJ2 320 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR2G2Q8NGZ5 317 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR2AE1Q8NHA4 323 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SLC25A40Q8TBP6 338 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 COG8Q96MW5 612 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR2J1Q9GZK6 312 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 G6PC2Q9NQR9 355 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CA10Q9NS85 328 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FRRS1LQ9P0K9 344 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FZR1Q9UM11 496 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 LRBAP50851 2863 aa7.33□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MAGEA13PA6NCF6 341 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 H3BSH0 61 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 J3QW42 95 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 P2RY10O00398 339 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 XRCC2O43543 280 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 GOSR1O95249 250 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TTRP02766 147 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 GLRXP35754 106 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TGM4P49221 684 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FABP6P51161 128 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CCR9P51686 369 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TAS2R43P59537 309 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF92Q03936 586 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SLC3A1Q07837 685 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CDK5R1Q15078 307 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 NEDD8Q15843 81 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC58Q4VC31 144 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FDX2Q6P4F2 183 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM200AQ86VY9 491 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 C1orf174Q8IYL3 243 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM171Q8WVE6 324 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 FCGR1BQ92637 280 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SGK3Q96BR1 496 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 REEP6Q96HR9 211 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.31□□□□□ -1.24
SGMS1-211ENST00000626236 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms