RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609284.1

NUP50-AS1-203, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NUP50-AS1, Length 710 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HMG20AQ9NP66 347 aa7.85□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OBP2BQ9NPH6 170 aa7.85□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BRD7Q9NPI1 651 aa7.85□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GPR84Q9NQS5 396 aa7.85□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 B3GNT2Q9NY97 397 aa7.85□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FOXJ3Q9UPW0 622 aa7.85□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SMIM30A4D0T7 59 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CLDN25C9JDP6 229 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 J3QW42 95 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 AIPO00170 330 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ICMTO60725 284 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RAD51DO75771 328 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DHRS3O75911 302 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NCR1O76036 304 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PATE4P0C8F1 98 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BMP4P12644 408 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SRMP19623 302 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ANOS1P23352 680 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 APEX1P27695 318 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HOXC12P31275 282 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OPRM1P35372 400 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 THBS2P35442 1172 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PSMD7P51665 324 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CAV3P56539 151 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR10A3P58181 314 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PPP3R1P63098 170 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PLP2Q04941 152 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF846Q147U1 533 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 STAC2Q6ZMT1 411 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 COLCA1Q6ZS62 124 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BEND4Q6ZU67 534 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LUZP2Q86TE4 346 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 COMMD2Q86X83 199 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLC7A6Q92536 515 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ITFG2Q969R8 447 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C10orf35Q96D05 121 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 WBP1Q96G27 269 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GFI1Q99684 422 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MRI1Q9BV20 369 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PIGMQ9H3S5 423 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RNF121Q9H920 327 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PALMDQ9NP74 551 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CMAHPQ9Y471 501 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.84□□□□□ -1.15
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ESPL1Q14674 2120 aa7.84□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 A0A1W2PPK0 400 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MSTNO14793 375 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TBX1O43435 398 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 XRCC2O43543 280 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LYZL6O75951 148 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 EPXP11678 715 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CD79AP11912 226 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF20P17024 532 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ADRA2CP18825 462 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ATF1P18846 271 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 STOMP27105 288 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 THBS4P35443 961 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MAGEB1P43366 347 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BMXP51813 675 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SCAND1P57086 179 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RAB1AP62820 205 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SNAI3Q3KNW1 292 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF529Q6P280 563 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MZT2AQ6P582 158 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MRGPRGQ86SM5 289 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CCDC190Q86UF4 302 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MDP1Q86V88 176 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF584Q8IVC4 421 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LAX1Q8IWV1 398 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR1J2Q8NGS2 313 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BORCS5Q969J3 196 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SPSB4Q96A44 273 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 POM121L2Q96KW2 1035 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF75AQ96N20 296 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OPA3Q9H6K4 179 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TINAGQ9UJW2 476 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 V9GYS6 101 aa7.83□□□□□ -1.16
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms