RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592483.5

CAPNS1-214, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 431 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-214ENST00000592483 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 LRP12Q9Y561 859 aa20.34■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 SVEP1Q4LDE5 3571 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ACOD1A6NK06 481 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 M0R135 149 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MYL12BO14950 172 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 NAAAQ02083 359 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 NCMAPQ5T1S8 102 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ALKBH2Q6NS38 261 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 LRRN1Q6UXK5 716 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 C1orf174Q8IYL3 243 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF799Q96GE5 643 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MS4A3Q96HJ5 214 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF696Q9H7X3 374 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ELOVL3Q9HB03 270 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 ERVK-18Q9QC07 812 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.33■□□□□ 0.85
CAPNS1-214ENST00000592483 LOC100509620A0A075B734 347 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 C5orf49A4QMS7 147 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 GPRIN2O60269 458 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ABHD16AO95870 558 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 MT-ND5P03915 603 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CELA3BP08861 270 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ETV1P50549 477 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 IRF3Q14653 427 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SPATC1Q76KD6 591 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SVOPQ8N4V2 548 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 YIPF7Q8N8F6 280 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 MND1Q9BWT6 205 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 MOB1AQ9H8S9 216 aa20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 PRR32B1ATL7 298 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 MT-ND2P03891 347 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ACSM4P0C7M7 580 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF35P13682 527 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 TUBG1P23258 451 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF544Q6NX49 715 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF283Q8N7M2 679 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 COG8Q96MW5 612 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 DOK1Q99704 481 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC90BQ9GZT6 254 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SHARPINQ9H0F6 387 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 TUBG2Q9NRH3 451 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 TBCCD1Q9NVR7 557 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 GNG8Q9UK08 70 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SPEF1Q9Y4P9 236 aa20.31■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 DPRXA6NFQ7 191 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 F5H5K5 113 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 KCNAB3O43448 404 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ADRA2AP08913 450 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 MMP16P51512 607 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 GALK2Q01415 458 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 MVKQ03426 396 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 BSPH1Q075Z2 132 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF773Q6PK81 442 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 NANOGP1Q8N7R0 232 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 PLPPR2Q96GM1 343 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 C4orf36Q96KX1 117 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 TTTY10Q9BZA0 68 aa20.3■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 MGAM2Q2M2H8 2515 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 J3QLW9 94 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CD3EP07766 207 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ZNF19P17023 458 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CX3CR1P49238 355 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 WNT4P56705 351 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 OR12D2P58182 307 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 TP53I3Q53FA7 332 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 LIPNQ5VXI9 398 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 ADAM5Q6NVV9 412 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 COLCA1Q6ZS62 124 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SGCDQ92629 289 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 C4orf45Q96LM5 186 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 BCL2L14Q9BZR8 327 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CLEC2DQ9UHP7 191 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 R4GMQ9 66 aa20.29■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 A0A087WXM4 84 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 PSMD9O00233 223 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 IGHV4-39P01824 125 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 HTR1AP08908 422 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 DBHP09172 617 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CCNOP22674 350 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 RAD52P43351 418 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 SLC6A9P48067 706 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 PRKXP51817 358 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 TAS2R43P59537 309 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 TMEM249Q2WGJ8 235 aa20.28■□□□□ 0.84
CAPNS1-214ENST00000592483 CCDC58Q4VC31 144 aa20.28■□□□□ 0.84
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