RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 C3orf80F5H4A9 247 aa21.23■□□□□ 0.99
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CAPNS1-211ENST00000590874 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4K13Q8NH42 304 aa21.21■□□□□ 0.99
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CAPNS1-211ENST00000590874 C7orf34Q96L11 122 aa21.19■□□□□ 0.98
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CAPNS1-211ENST00000590874 ARPC3O15145 178 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 COX4I1P13073 169 aa21.18■□□□□ 0.98
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF826PQ6ZT77 177 aa21.18■□□□□ 0.98
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF799Q96GE5 643 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 NOTCH1P46531 2555 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 OR6C68A6NDL8 312 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 GMDSO60547 372 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 TSPAN15O95858 294 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 HLA-DQA2P01906 255 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-211ENST00000590874 RPS27P42677 84 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
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