RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-215	ENST00000589825	PCK2	Q16822	640 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	KLHL12	Q53G59	568 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	PLBD1	Q6P4A8	553 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	NRBF2	Q96F24	287 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	TOR3A	Q9H497	397 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	OPA3	Q9H6K4	179 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		13.58	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM178B	H3BS89	294 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	TBX1	O43435	398 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	XRCC2	O43543	280 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	TIPRL	O75663	272 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	HLA-DPB1	P04440	258 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	GATA3	P23771	443 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	MMP16	P51512	607 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	OCEL1	Q9H607	264 aa		13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	PAPOLB	Q9NRJ5	636 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ATR	Q13535	2644 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	CD300LB	A8K4G0	201 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825		J3QLI3	93 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	MLNR	O43193	412 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRODH	O43272	600 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	TCF21	O43680	179 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	H2BFM	P0C1H6	154 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC2A1	P11166	492 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	CX3CR1	P49238	355 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	LCN2	P80188	198 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	CDK5	Q00535	292 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF92	Q03936	586 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	SNAPC1	Q16533	368 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	TIGD6	Q17RP2	521 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	CPO	Q8IVL8	374 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	THEM6	Q8WUY1	208 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ERGIC1	Q969X5	290 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ABHD6	Q9BV23	337 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	GMDS	O60547	372 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	CIB2	O75838	187 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	LYN	P07948	512 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	PSKH1	P11801	424 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	CA6	P23280	308 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	FAS	P25445	335 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZMYND11	Q15326	602 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ESCO2	Q56NI9	601 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	SPERT	Q8NA61	448 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	MARCH7	Q9H992	704 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		13.55	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	PPIAL4D	F5H284	164 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825		G3V2T6	193 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	FCGR1A	P12314	374 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	DDOST	P39656	456 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	CRISP1	P54107	249 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	TIGD4	Q8IY51	512 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		13.54	□□□□□ -0.24
EFTUD2-215	ENST00000589825	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		13.54	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 507.5 ms