RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589055.3

TMEM259-206, Transcript of transmembrane protein 259, human

TSL 3

Gene TMEM259, Length 791 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM259-206	ENST00000589055	MPPED2	Q15777	294 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	NANP	Q8TBE9	248 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	SPTSSA	Q969W0	71 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	FEV	Q99581	238 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ESM1	Q9NQ30	184 aa		13.38	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	CD300LB	A8K4G0	201 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055		A8MXK9	166 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	FAM20B	O75063	409 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	CST1	P01037	141 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	WNT2	P09544	360 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF12	P17014	697 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	GATA3	P23771	443 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF154	Q13106	437 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	PCK2	Q16822	640 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ESCO2	Q56NI9	601 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	GIPC3	Q8TF64	312 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	OTULIN	Q96BN8	352 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	AMELY	Q99218	206 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		13.37	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055		A0A0A6YYJ9	748 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	DHRS12	A0PJE2	317 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	PPIAL4D	F5H284	164 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055		H3BN98	237 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	IFNG	P01579	166 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF3	P17036	446 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	POU1F1	P28069	291 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	CD200	P41217	278 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	RAD23A	P54725	363 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	SCGB2A2	Q13296	93 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	TAF13	Q15543	124 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	OR8G1	Q15617	311 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	KLB	Q86Z14	1044 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	TEX29	Q8N6K0	151 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	C1orf21	Q9H246	121 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	CMC2	Q9NRP2	79 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.36	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	IFNL4	K9M1U5	179 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	TBX1	O43435	398 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	CD80	P33681	288 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	GRK5	P34947	590 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	GATA4	P43694	442 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	CX3CR1	P49238	355 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ACTG1	P63261	375 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	PAX2	Q02962	417 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF404	Q494X3	552 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	DRAM2	Q6UX65	266 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	KCNJ15	Q99712	375 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	AQP12B	A6NM10	295 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	LRRC30	A6NM36	301 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ZNF878	C9JN71	531 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	PRKACG	P22612	351 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	TEX30	Q5JUR7	227 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	USP43	Q70EL4	1123 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055		Q8TCH9	128 aa		13.34	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
TMEM259-206	ENST00000589055	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.34	□□□□□ -0.27

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