RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 COL6A5A8TX70 2615 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 RIIAD1A6NNX1 92 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 RNF212BA8MTL3 300 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 FAM157AC9JC47 383 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 J3QW42 95 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 GYPBP06028 91 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 MSMBP08118 114 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 SPARCP09486 303 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 SBK2P0C263 348 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 SELEP16581 610 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF3P17036 446 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 KITLGP21583 273 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 MYF6P23409 242 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 DCKP27707 260 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 FMO3P31513 532 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A9P48067 706 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 HIST1H3AP68431 136 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ECH1Q13011 328 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 CDK5R2Q13319 367 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 CRMP1Q14194 572 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 GK3PQ14409 553 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 OR2T2Q6IF00 324 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ACSM5Q6NUN0 579 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 SLC27A4Q6P1M0 643 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 CFAP77Q6ZQR2 320 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 HIST2H3AQ71DI3 136 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 GPR141Q7Z602 305 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ADGRG5Q8IZF4 528 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 LNX2Q8N448 690 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 GALNT4Q8N4A0 578 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 BHLHE23Q8NDY6 225 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 OR51F2Q8NH61 342 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 CHPT1Q8WUD6 406 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 SPTSSAQ969W0 71 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM186Q96B77 213 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 FAHD2AQ96GK7 314 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 MDFIQ99750 246 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ATF6BQ99941 703 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 CENPMQ9NSP4 180 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 M0R135 149 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 CD55P08174 381 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ADH4P08319 380 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ACSM4P0C7M7 580 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 CLUP10909 449 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 GGT2P36268 569 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ENTPD1P49961 510 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 RAD23AP54725 363 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 SPRNQ5BIV9 151 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 LYPD4Q6UWN0 246 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZR03 302 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 SPATC1Q76KD6 591 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 DCXRQ7Z4W1 244 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 NAA40Q86UY6 237 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF511Q8NB15 262 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 OR8G5Q8NG78 346 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ST7LQ8TDW4 575 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ITLN1Q8WWA0 313 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 EME1Q96AY2 570 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 SLCO4A1Q96BD0 722 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF799Q96GE5 643 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 C1orf159Q96HA4 380 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 MAP6Q96JE9 813 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 OR2V2Q96R30 315 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 DDOQ99489 341 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 COPS4Q9BT78 406 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 TEX12Q9BXU0 123 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM100Q9NV29 134 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 IL19Q9UHD0 177 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 NPTNQ9Y639 398 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.04□□□□□ -1.28
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