RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 KCNG2Q9UJ96 466 aa5.73□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0B4J2A0 478 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.73□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 OR52A4PA6NMU1 304 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa5.73□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC35E2P0CK97 266 aa5.72□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 JMJD8Q96S16 334 aa5.72□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 A0A1B0GUL6 1792 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
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PTPRB-210ENST00000551525 VAMP5O95183 116 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 HBE1P02100 147 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 PLAURQ03405 335 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 SMAGPQ0VAQ4 97 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 FAM53BQ14153 422 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 TECRLQ5HYJ1 363 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 CRB2Q5IJ48 1285 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 OR2T27Q8NH04 317 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRB-210ENST00000551525 INPP5KQ9BT40 448 aa5.72□□□□□ -1.49
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