RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543002.5

RABGGTA-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 1,329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTA-203ENST00000543002 LAIR2Q6ISS4 152 aa14.62□□□□□ -0.07
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RABGGTA-203ENST00000543002 PGAP1Q75T13 922 aa14.62□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
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RABGGTA-203ENST00000543002 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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RABGGTA-203ENST00000543002 METTL15A6NJ78 407 aa14.61□□□□□ -0.07
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RABGGTA-203ENST00000543002 F12P00748 615 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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RABGGTA-203ENST00000543002 R4GMQ9 66 aa14.6□□□□□ -0.07
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RABGGTA-203ENST00000543002 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.59□□□□□ -0.07
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RABGGTA-203ENST00000543002 Q5PR19 223 aa14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 FAM220AQ7Z4H9 259 aa14.59□□□□□ -0.07
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RABGGTA-203ENST00000543002 OR5AS1Q8N127 324 aa14.59□□□□□ -0.07
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RABGGTA-203ENST00000543002 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RABGGTA-203ENST00000543002 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-203ENST00000543002 A0A0U1RQV5 110 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-203ENST00000543002 EFCAB10A6NFE3 127 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-203ENST00000543002 GGT3PA6NGU5 568 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-203ENST00000543002 CD300LBA8K4G0 201 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-203ENST00000543002 XPNPEP2O43895 674 aa14.58□□□□□ -0.08
RABGGTA-203ENST00000543002 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
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