RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542133.5

NPIPB4-215, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B4, human

TSL 3

Gene NPIPB4, Length 910 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPIPB4-215	ENST00000542133	PFDN5	Q99471	154 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	SERPINI1	Q99574	410 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	SLC6A7	Q99884	636 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	NICN1	Q9BSH3	213 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	MND1	Q9BWT6	205 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	CSTL1	Q9H114	145 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	SIAE	Q9HAT2	523 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	HEYL	Q9NQ87	328 aa	Predicted RBP	6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	TREM2	Q9NZC2	230 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	CNOT2	Q9NZN8	540 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	CES1P1	Q9UKY3	287 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	ALG5	Q9Y673	324 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	AUP1	Q9Y679	476 aa		6.64	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133		A0A1W2PR80	420 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	C1orf226	A1L170	272 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	C9orf170	A2RU37	121 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	C7orf72	A4D263	438 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	SMLR1	H3BR10	107 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	ARPC5	O15511	151 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	SGCE	O43556	437 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	BANF1	O75531	89 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	TTC4	O95801	387 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	FAM107A	O95990	144 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	WNT11	O96014	354 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	CST4	P01036	141 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	MT-ND1	P03886	318 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	CRYGB	P07316	175 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	SCGB1A1	P11684	91 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	TSPAN8	P19075	237 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	HLA-DMA	P28067	261 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	SHC1	P29353	583 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	ECI1	P42126	302 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	UFM1	P61960	85 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	EFNB1	P98172	346 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	EGR3	Q06889	387 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	SLC29A2	Q14542	456 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	OR4D1	Q15615	310 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	GALNTL6	Q49A17	601 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	COX19	Q49B96	90 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	REEP3	Q6NUK4	255 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	FCRLA	Q7L513	359 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	LILRA2	Q8N149	483 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	METTL4	Q8N3J2	472 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	FAM110B	Q8TC76	370 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF675	Q8TD23	568 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	SCARB1	Q8WTV0	552 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	KLHL29	Q96CT2	875 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	CPNE1	Q99829	537 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	FKRP	Q9H9S5	495 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	HHATL	Q9HCP6	504 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	BIN3	Q9NQY0	253 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	RNF14	Q9UBS8	474 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133		H3BN98	237 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	GOSR2	O14653	212 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	PHYH	O14832	338 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	OR10H3	O60404	316 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	SELENOF	O60613	162 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	RAMP3	O60896	148 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	MPIG6B	O95866	241 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	MSMB	P08118	114 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	FAM157B	P0CG42	384 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	CEACAM3	P40198	252 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	PPOX	P50336	477 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	RAP1B	P61224	184 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	PSG6	Q00889	435 aa		6.62	□□□□□ -1.35
NPIPB4-215	ENST00000542133	ZNF91	Q05481	1191 aa		6.62	□□□□□ -1.35

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms