RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 OR5B21A6NL26 309 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 LEFTY2O00292 366 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 HSD17B6O14756 317 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 FRS3O43559 492 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 NDUFB8O95169 186 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 OR6A2O95222 327 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SEMA4FO95754 770 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 IGLV3-25P01717 112 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 HBE1P02100 147 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF735P0CB33 412 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 PGA3P0DJD8 388 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 PTHLHP12272 177 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 MPLP40238 635 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SLC6A12P48065 614 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 RAB28P51157 221 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 HLA-DRB3P79483 266 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 PMS2P11Q13670 270 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 TNFAIP1Q13829 316 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ARL6IP1Q15041 203 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SLC9A3R2Q15599 337 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 OR7A5Q15622 319 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CTSL3PQ5NE16 218 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 AGBL4Q5VU57 503 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 FAM71F2Q6NXP2 309 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ACOT1Q86TX2 421 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 C17orf64Q86WR6 236 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 FAM129CQ86XR2 697 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CLECL1Q8IZS7 167 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 GPR32P1Q8NGA4 272 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 MFSD8Q8NHS3 518 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CLEC4CQ8WTT0 213 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 NUDT8Q8WV74 236 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 MAL2Q969L2 176 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 TOMM40LQ969M1 308 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 NEURL3Q96EH8 262 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF479Q96JC4 524 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 LMLNQ96KR4 655 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 OR7D2Q96RA2 312 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SLC6A7Q99884 636 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 VAMP8Q9BV40 100 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 OR51I1Q9H343 314 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 PXMP2Q9NR77 195 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 BET1LQ9NYM9 111 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SLC23A2Q9UGH3 650 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CD84Q9UIB8 345 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 TBX21Q9UL17 535 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 FUT9Q9Y231 359 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 WIPI2Q9Y4P8 454 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 KIAA1671Q9BY89 1806 aa5.5□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 A0A1W2PRU2 124 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 OR6C6A6NF89 314 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF860A6NHJ4 632 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 NPIPA7E9PJI5 369 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 H3BNC9 293 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CORTO00230 105 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 XKRYO14609 159 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SLC25A17O43808 307 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 LILRA1O75019 489 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 GPR32O75388 356 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 LRATO95237 230 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ABHD16AO95870 558 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CYB5AP00167 134 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SRP19P09132 144 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 NPIPA8P0DM63 369 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 OR13C7P0DN81 318 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CXCL8P10145 99 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 CTSEP14091 401 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 FAHP16930 419 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF19P17023 458 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 TNFRSF1BP20333 461 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP5.49□□□□□ -1.534e-6■■■■□ 22.9
SNHG1-211ENST00000539921 THPOP40225 353 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 NSG1P42857 185 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 P2RY1P47900 373 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 PPOXP50336 477 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 OAZ1P54368 228 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SOX10P56693 466 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 SIRPAP78324 504 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 IL13RA1P78552 427 aa5.49□□□□□ -1.53
SNHG1-211ENST00000539921 LTBQ06643 244 aa5.49□□□□□ -1.53
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