RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	LIPN	Q5VXI9	398 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	VHLL	Q6RSH7	139 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	MUC15	Q8N387	334 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	MND1	Q9BWT6	205 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	SLC22A4	Q9H015	551 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	CXorf56	Q9H5V9	222 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	13.16	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730		A0A0U1RQV5	110 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	PLSCR5	A0PG75	271 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730		E7EQL1	145 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730		J3QLW9	94 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	TBX1	O43435	398 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	XPNPEP2	O43895	674 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	HTR1A	P08908	422 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	OR4A8	P0C604	315 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF19	P17023	458 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	THBS4	P35443	961 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	WNT5A	P41221	380 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	CCR9	P51686	369 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	SLC35A2	P78381	396 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	SPOCK1	Q08629	439 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	FDX2	Q6P4F2	183 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	PGAP1	Q75T13	922 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	SLC7A6	Q92536	515 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	C4orf36	Q96KX1	117 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	AMELY	Q99218	206 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	ABCB9	Q9NP78	766 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
BBS1-224	ENST00000534730	VPS13C	Q709C8	3753 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1W2PPW3	197 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	TNFAIP8	O95379	198 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	IGHV3-13	P01766	116 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	PSKH1	P11801	424 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	TGM4	P49221	684 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	DTX2	Q86UW9	622 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	SLC25A40	Q8TBP6	338 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	HAVCR1	Q96D42	359 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	OR2J1	Q9GZK6	312 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	DUSP13	Q9UII6	198 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		13.14	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730		M0R233	179 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	PLAU	P00749	431 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	RAF1	P04049	648 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	LIMS3	P0CW19	117 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	LIMS4	P0CW20	117 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	KITLG	P21583	273 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	WNT4	P56705	351 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	BDH1	Q02338	343 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	TP53I3	Q53FA7	332 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	RPL22L1	Q6P5R6	122 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	COMMD2	Q86X83	199 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	KLB	Q86Z14	1044 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	FCGR1B	Q92637	280 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	THRSP	Q92748	146 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	NINJ1	Q92982	152 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	CCL19	Q99731	98 aa		13.13	□□□□□ -0.31
BBS1-224	ENST00000534730	PBOV1	Q9GZY1	135 aa		13.13	□□□□□ -0.31

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