RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528494.5

ATG13-211, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG13, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-211ENST00000528494 TMEM225Q6GV28 225 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 NTNG2Q96CW9 530 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 FAM117AQ9C073 453 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 NPIPA1Q9UND3 350 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 FREM3P0C091 2139 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 PTPRBP23467 1997 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 TMEM218A2RU14 115 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 PRSS37A4D1T9 235 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 SLC16A7O60669 478 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 HLA-DQA2P01906 255 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 CNR1P21554 472 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 MTNR1BP49286 362 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 DGCR2P98153 550 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 HSF1Q00613 529 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 NHLH1Q02575 133 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 OR2B11Q5JQS5 317 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 TEX30Q5JUR7 227 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 RPTNQ6XPR3 784 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 SLC35D2Q76EJ3 337 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 SLC35F2Q8IXU6 374 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 TMEM185AQ8NFB2 350 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 OR6K3Q8NGY3 331 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 ZNF519Q8TB69 540 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 C4orf36Q96KX1 117 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 ZFP3Q96NJ6 502 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 PIGMQ9H3S5 423 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 KLHL13Q9P2N7 655 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 ZNF69Q9UC07 566 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 CEP295Q9C0D2 2601 aa11.36□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 E9PI62 339 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 TNFSF11O14788 317 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 GPR37O15354 613 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 POU4F2Q12837 409 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 TP53I3Q53FA7 332 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 TMPPEQ6ZT21 453 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 SULF2Q8IWU5 870 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 EXD3Q8N9H8 876 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 PIGQQ9BRB3 760 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 FXYD6Q9H0Q3 95 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 OR10A4Q9H209 315 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 WDR76Q9H967 626 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 RASD1Q9Y272 281 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 DMRT1Q9Y5R6 373 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 UBL3O95164 117 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 CTLA4P16410 223 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 RIDAP52758 137 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 SLC25A1P53007 311 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 BIDP55957 195 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 FMODQ06828 376 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 FOXO1Q12778 655 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 SLC35D3Q5M8T2 416 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 OR2M7Q8NG81 312 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 RASL12Q9NYN1 266 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 B3GAT1Q9P2W7 334 aa11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 A0A1B0GWJ7 208 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 FAM166BA8MTA8 275 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 CLN5O75503 358 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 SC5DO75845 299 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 CELA3AP09093 270 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 GALP22466 123 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 SRD5A2P31213 254 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 THBS2P35442 1172 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 GMFBP60983 142 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 CARD17Q5XLA6 110 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 MOB3CQ70IA8 216 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 PXKQ7Z7A4 578 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 NAA40Q86UY6 237 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 POMGNT2Q8NAT1 580 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 SNX33Q8WV41 574 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 PNPLA2Q96AD5 504 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 MIB2Q96AX9 1013 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 UCN2Q96RP3 112 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 B9D1Q9UPM9 204 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 CACNA1CQ13936 2221 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 A0A0J9YW62 118 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 A0A1B0GV90 55 aa11.34□□□□□ -0.59
ATG13-211ENST00000528494 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms