RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518720.5

TSNARE1-202, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-202ENST00000518720 PRSS45Q7RTY3 260 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 LRP11Q86VZ4 500 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 OR52N1Q8NH53 320 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SYNPRQ8TBG9 265 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 NRGNQ92686 78 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SIGLEC11Q96RL6 698 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 PLK3Q9H4B4 646 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 FAIMQ9NVQ4 179 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 OR52A1Q9UKL2 312 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SNX5Q9Y5X3 404 aa14.73□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 AKAP6Q13023 2319 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 XRCC2O43543 280 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 CLPTM1O96005 669 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SERPINF1P36955 418 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MMP16P51512 607 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 CHN2P52757 468 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 CDH15P55291 814 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF92Q03936 586 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 WDR38Q5JTN6 314 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 CATSPERDQ86XM0 798 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 KLBQ86Z14 1044 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MUC15Q8N387 334 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF611Q8N823 705 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 PPP1R14AQ96A00 147 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 REEP6Q96HR9 211 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MND1Q9BWT6 205 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 G6PC2Q9NQR9 355 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SLC22A13Q9Y226 551 aa14.72□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 TMEM129A0AVI4 362 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 H3BSA7 217 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ZNF250P15622 560 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 TTKP33981 857 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 WNT4P56705 351 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 SELENOVP59797 346 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 PGAP1Q75T13 922 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 CMBLQ96DG6 245 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 CDCA4Q9BXL8 241 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 LAMP3Q9UQV4 416 aa14.71□□□□□ -0.05
TSNARE1-202ENST00000518720 DCHS2Q6V1P9 2916 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 ACOD1A6NK06 481 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 E9PI62 339 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 H3BSH0 61 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 TTRP02766 147 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 SOD3P08294 240 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 KIR3DL2P43630 455 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 MAP2K4P45985 399 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 IRF3Q14653 427 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 NKPD1Q17RQ9 610 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 KCTD21Q4G0X4 260 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 AGAP6Q5VW22 663 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 OR2T2Q6IF00 324 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 OR5AS1Q8N127 324 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 NANOGP1Q8N7R0 232 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 ZFP41Q8N8Y5 198 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 BHLHE23Q8NDY6 225 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 CCL19Q99731 98 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 OPA3Q9H6K4 179 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.7□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 GGT3PA6NGU5 568 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 P2RY10O00398 339 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 TNFAIP8O95379 198 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 LALBAP00709 142 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 DANCRP0C864 163 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 RAC2P15153 192 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 TUBG1P23258 451 aa14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSNARE1-202ENST00000518720 PSG7Q13046 419 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms