RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517517.1

RRM2B-204, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B, human

TSL 4

Gene RRM2B, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2B-204	ENST00000517517	CD300LB	A8K4G0	201 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	TRIM77	I1YAP6	450 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	FAM20B	O75063	409 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	CCNB2	O95067	398 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	CA6	P23280	308 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	CD200	P41217	278 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	GATA4	P43694	442 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	PRKX	P51817	358 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	MXRA7	P84157	204 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	ECH1	Q13011	328 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	PCK2	Q16822	640 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF404	Q494X3	552 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	LCN8	Q6JVE9	175 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	SPATC1	Q76KD6	591 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	LNX2	Q8N448	690 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	CCT8L2	Q96SF2	557 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	AMELY	Q99218	206 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	MED20	Q9H944	212 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	NUP50	Q9UKX7	468 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RRM2B-204	ENST00000517517	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	C22orf46	C9J442	243 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	DCTN3	O75935	186 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF823	P16415	610 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	SPI1	P17947	270 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	EGR1	P18146	543 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	TPTE	P56180	551 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	MICA	Q29983	383 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	SPATS1	Q496A3	300 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	ESCO2	Q56NI9	601 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	AWAT1	Q58HT5	328 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	PGAP1	Q75T13	922 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	DOK3	Q7L591	496 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	TEX29	Q8N6K0	151 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	OR52L1	Q8NGH7	329 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517		Q8TCH9	128 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	NSL1	Q96IY1	281 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	TBC1D23	Q9NUY8	699 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	N6AMT1	Q9Y5N5	214 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	FAM183A	A6NL82	134 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	SPARC	P09486	303 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	ENTPD1	P49961	510 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	SLC25A1	P53007	311 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	SCGB2A2	Q13296	93 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	WDR86	Q86TI4	376 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	FGFRL1	Q8N441	504 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	OR2T4	Q8NH00	348 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	OR2T29	Q8NH02	315 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	CENPM	Q9NSP4	180 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	DHRS12	A0PJE2	317 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	IFNL4	K9M1U5	179 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	ACOT8	O14734	319 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	FPR2	P25090	351 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	PSMB10	P40306	273 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	PITPNB	P48739	271 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	GNB2	P62879	340 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	GUCA2A	Q02747	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	POU4F2	Q12837	409 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	MALL	Q13021	153 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	OR8G1	Q15617	311 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	KLHL12	Q53G59	568 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RRM2B-204	ENST00000517517	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.18	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms