RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SERPINB8P50452 374 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP12-4P60329 112 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RAB10P61026 200 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 LIPEQ05469 1076 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TAF9Q16594 264 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLHL12Q53G59 568 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 YIF1BQ5BJH7 314 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM222AQ5U5X8 452 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 LRRC66Q68CR7 880 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPINT4Q6UDR6 99 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZYG11AQ6WRX3 759 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 STK40Q8N2I9 435 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC35G3Q8N808 338 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 C1orf64Q8NEQ6 169 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR4M1Q8NGD0 313 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR5K2Q8NHB8 316 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RASD2Q96D21 266 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TPD52L3Q96J77 140 aa0.96□□□□□ -2.26
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RNU6-344P-201ENST00000516635 PKIBQ9C010 78 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMEM38AQ9H6F2 299 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC39A1Q9NY26 324 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 MTCH1Q9NZJ7 389 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 HPCAL4Q9UM19 191 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 LTBP4Q8N2S1 1624 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF407Q9C0G0 2248 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 C9JVG2 144 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNFRSF11BO00300 401 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 NME4O00746 187 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 NDUFAB1O14561 156 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 CIB2O75838 187 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 LSM8O95777 96 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TGM6O95932 706 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 CD160O95971 181 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PAHP00439 452 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 LHBP01229 141 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TCP1P17987 556 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 NTF3P20783 257 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 USF1P22415 310 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 GGT2P36268 569 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TALDO1P37837 337 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRKCDQ05655 676 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ART3Q13508 389 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PNOCQ13519 176 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 LUZP6Q538Z0 58 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TBPL2Q6SJ96 375 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 CASP12Q6UXS9 341 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TAS2R42Q7RTR8 314 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADM2Q7Z4H4 148 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 APCDD1LQ8NCL9 501 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR5AR1Q8NGP9 310 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR9G4Q8NGQ1 327 aa0.95□□□□□ -2.26
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RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNS1Q96KK3 526 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPR82Q96P67 336 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 C20orf24Q9BUV8 137 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUDT9Q9BW91 350 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP0.95□□□□□ -2.26
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RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF160Q9HCG1 818 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RHBDL2Q9NX52 303 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 DCAF16Q9NXF7 216 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SVILO95425 2214 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 NLRC5Q86WI3 1866 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYO16Q9Y6X6 1858 aa0.95□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIAA1671Q9BY89 1806 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCNX2A6NKB5 2137 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAV6A0A075B6T7 132 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDZK1P1A8MUH7 402 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLIN3O60664 434 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC19A2O60779 497 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 SNX4O95219 450 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGLV2-8P01709 118 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPN2P04844 631 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 MYL2P10916 166 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 CTRB1P17538 263 aa0.94□□□□□ -2.26
RNU6-344P-201ENST00000516635 RAB4AP20338 218 aa0.94□□□□□ -2.26
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