RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514110.5

SNHG4-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, human

TSL 1 (best)

Gene SNHG4, Length 679 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF799	Q96GE5	643 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		10.16	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	TVP23A	A6NH52	213 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	POM121C	A8CG34	1229 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	CD300LB	A8K4G0	201 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	IDH3B	O43837	385 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	FABP3	P05413	133 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	OMG	P23515	440 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF92	Q03936	586 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	TSPAN31	Q12999	210 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	OR8G1	Q15617	311 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	C16orf87	Q6PH81	154 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	SPATC1	Q76KD6	591 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	DDO	Q99489	341 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	RNF7	Q9UBF6	113 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	CD300A	Q9UGN4	299 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		10.15	□□□□□ -0.78
SNHG4-208	ENST00000514110	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	BHLHE40	O14503	412 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	ARPC2	O15144	300 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	SFTPB	P07988	381 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF823	P16415	610 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	IFNGR2	P38484	337 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	PROKR2	Q8NFJ6	384 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	SPTSSA	Q969W0	71 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	TECTB	Q96PL2	329 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	MED4	Q9NPJ6	270 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		10.14	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	GGT3P	A6NGU5	568 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	SRRM5	B3KS81	715 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	LGALS8	O00214	317 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	GMDS	O60547	372 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	FCN3	O75636	299 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	MMP9	P14780	707 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	CFHR2	P36980	270 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	NPY4R	P50391	375 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	OR8B8	Q15620	311 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	GPR157	Q5UAW9	335 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	TREML4	Q6UXN2	200 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	TBX15	Q96SF7	602 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	CDRT15	Q96T59	188 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC22A4	Q9H015	551 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	FAM107B	Q9H098	131 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	SLITRK2	Q9H156	845 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	MARCH7	Q9H992	704 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		10.13	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	OOEP	A6NGQ2	149 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	ZNF879	B4DU55	563 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	ADAM20	O43506	726 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	SNX3	O60493	162 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	TOX4	O94842	621 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	GYPB	P06028	91 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	GRP	P07492	148 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	SLC2A1	P11166	492 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	PRKX	P51817	358 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	HMGA2	P52926	109 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	BPIFB3	P59826	476 aa		10.12	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
SNHG4-208	ENST00000514110	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79

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