RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
TOPBP1-208	ENST00000511439	GALP	Q9UBC7	116 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		2.59	□□□□□ -1.99
TOPBP1-208	ENST00000511439	MUC2	Q02817	5179 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	XKRY2	A2RUG3	117 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439		H0YGG7	62 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439		H0YL77	283 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GFY	I3L273	518 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DFFA	O00273	331 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	WWP2	O00308	870 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MPZL1	O95297	269 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	C1QA	P02745	245 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	UMPS	P11172	480 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	LAMP1	P11279	417 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PGAM2	P15259	253 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PSMA2	P25787	234 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PCK1	P35558	622 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMED10	P49755	219 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC35A2	P78381	396 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	TATDN3	Q17R31	274 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CYBRD1	Q53TN4	286 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CGB2	Q6NT52	195 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	NIPAL3	Q6P499	406 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SBSN	Q6UWP8	590 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZYG11A	Q6WRX3	759 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF786	Q8N393	782 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR13C2	Q8NGS9	318 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GTSF1	Q8WW33	167 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MCHR2	Q969V1	340 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADIPOR1	Q96A54	375 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	TPD52L3	Q96J77	140 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	KAT8	Q9H7Z6	458 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACTR8	Q9H981	624 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	OPN4	Q9UHM6	478 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ASF1A	Q9Y294	204 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		2.58	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	HSPG2	P98160	4391 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GOLGA8Q	A0A0J9YX86	632 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM168B	A1KXE4	195 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GOLGA8O	A6NCC3	632 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAM220BP	B1ANY3	271 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GOLGA8N	F8WBI6	632 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439		H0YC42	278 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GOLGA8R	I6L899	631 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLC17A2	O00624	439 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	TM9SF1	O15321	606 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	MYO1D	O94832	1006 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANP32D	O95626	131 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	AP2A1	O95782	977 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	IGKV3-15	P01624	115 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CT45A10	P0DMU9	189 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	UQCRB	P14927	111 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	TSPAN8	P19075	237 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	FAS	P25445	335 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	HTR5A	P47898	357 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ALDH3B2	P48448	385 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	FNTA	P49354	379 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRLHR	P49683	370 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	EMD	P50402	254 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	TPI1	P60174	286 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	KRTAP10-8	P60410	259 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZMYND11	Q15326	602 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	PDK4	Q16654	411 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	HSDL2	Q6YN16	418 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CENPU	Q71F23	418 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	COMTD1	Q86VU5	262 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMEM86B	Q8N661	226 aa		2.57	□□□□□ -2
TOPBP1-208	ENST00000511439	CD177	Q8N6Q3	437 aa		2.57	□□□□□ -2

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