RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511313.5

POLR2J3-215, Transcript of RNA polymerase II subunit J3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLR2J3, Length 4,630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J3-215ENST00000511313 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa8.5□□□□□ -1.05
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POLR2J3-215ENST00000511313 CLCF1Q9UBD9 225 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 SLC23A1Q9UHI7 598 aa8.5□□□□□ -1.05
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POLR2J3-215ENST00000511313 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.5□□□□□ -1.05
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POLR2J3-215ENST00000511313 NDUFAF4Q9P032 175 aa8.5□□□□□ -1.05
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POLR2J3-215ENST00000511313 SSX4O60224 188 aa8.5□□□□□ -1.05
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POLR2J3-215ENST00000511313 RAB2AP61019 212 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 SLC17A1Q14916 467 aa8.5□□□□□ -1.05
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POLR2J3-215ENST00000511313 WDSUB1Q8N9V3 476 aa8.5□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 OR2M2Q96R28 347 aa8.5□□□□□ -1.05
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POLR2J3-215ENST00000511313 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa8.5□□□□□ -1.05
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POLR2J3-215ENST00000511313 Q499Y3 187 aa8.49□□□□□ -1.05
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POLR2J3-215ENST00000511313 PRKACAP17612 351 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 ATF1P18846 271 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 IL12AP29459 219 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 KIR2DS2P43631 304 aa8.49□□□□□ -1.05
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POLR2J3-215ENST00000511313 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 ISYNA1Q9NPH2 558 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 TEX46H3BTG2 121 aa8.49□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
POLR2J3-215ENST00000511313 AIREO43918 545 aa8.49□□□□□ -1.05
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