RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 COLCA1Q6ZS62 124 aa13.04□□□□□ -0.32
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SH3BP2-215ENST00000510074 PITX2Q99697 317 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-215ENST00000510074 NUAK2Q9H093 628 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-215ENST00000510074 SIGLEC9Q9Y336 463 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-215ENST00000510074 PLXNB1O43157 2135 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-215ENST00000510074 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa13.03□□□□□ -0.32
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SH3BP2-215ENST00000510074 HIST1H3AP68431 136 aa13.03□□□□□ -0.32
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SH3BP2-215ENST00000510074 MEP1BQ16820 701 aa13.03□□□□□ -0.32
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SH3BP2-215ENST00000510074 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa13.03□□□□□ -0.32
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SH3BP2-215ENST00000510074 HIST2H3AQ71DI3 136 aa13.03□□□□□ -0.32
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SH3BP2-215ENST00000510074 FOXJ3Q9UPW0 622 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-215ENST00000510074 LHFPL6Q9Y693 200 aa13.03□□□□□ -0.32
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SH3BP2-215ENST00000510074 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 MZT1Q08AG7 82 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 DNM1P34Q6PK57 102 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 TBPL2Q6SJ96 375 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 ZNF826PQ6ZT77 177 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 ADCK1Q86TW2 530 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 CALHM3Q86XJ0 350 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 OR4S1Q8NGB4 309 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 OR4C13Q8NGP0 309 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 OR2T6Q8NHC8 308 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 ITPKCQ96DU7 683 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM234AQ9H0X4 552 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
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SH3BP2-215ENST00000510074 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa13.01□□□□□ -0.33
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SH3BP2-215ENST00000510074 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 IMPA2O14732 288 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 NDUFB2O95178 105 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 IFNW1P05000 195 aa13.01□□□□□ -0.33
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SH3BP2-215ENST00000510074 TPTEP56180 551 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 MICBQ29980 383 aa13.01□□□□□ -0.33
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SH3BP2-215ENST00000510074 OFCC1Q8IZS5 231 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 DTX3Q8N9I9 347 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 OR8J3Q8NGG0 315 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 CFHR4Q92496 578 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 TLCD1Q96CP7 247 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 DMRTB1Q96MA1 342 aa13.01□□□□□ -0.33
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SH3BP2-215ENST00000510074 ATF6BQ99941 703 aa13.01□□□□□ -0.33
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SH3BP2-215ENST00000510074 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 SNX13Q9Y5W8 968 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 J3KTA2 159 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 NDUFB3O43676 98 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
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SH3BP2-215ENST00000510074 GRK5P34947 590 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 EFNB2P52799 333 aa13□□□□□ -0.33
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SH3BP2-215ENST00000510074 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa13□□□□□ -0.33
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SH3BP2-215ENST00000510074 GCSAMQ8N6F7 178 aa13□□□□□ -0.33
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SH3BP2-215ENST00000510074 LY6G5BQ8NDX9 201 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 PPP1R35Q8TAP8 253 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 DYDC1Q8WWB3 177 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 CLPTM1LQ96KA5 538 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 TSSK2Q96PF2 358 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 TMBIM4Q9HC24 238 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 NRIP3Q9NQ35 241 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-215ENST00000510074 C14orf119Q9NWQ9 140 aa13□□□□□ -0.33
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