RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507965.5

ATXN3-210, Transcript of ataxin 3, human

TSL 2

Gene ATXN3, Length 708 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-210	ENST00000507965	UPRT	Q96BW1	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	GPA33	Q99795	319 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	POLE4	Q9NR33	117 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	MAN2C1	Q9NTJ4	1040 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	RIMS3	Q9UJD0	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	STARD10	Q9Y365	291 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	MED31	Q9Y3C7	131 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965		F5H5P2	479 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965		H3BUI4	141 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965		J3KTA2	159 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	SGCE	O43556	437 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	IGF2	P01344	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	SFTPB	P07988	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	WNT2	P09544	360 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	CTLA4	P16410	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	KITLG	P21583	273 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	LIPA	P38571	399 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	GPR4	P46093	362 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC9A3	P48764	834 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	RAG2	P55895	527 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	FGF12	P61328	243 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	GNB2	P62879	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	INTS11	Q5TA45	600 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	OR2T2	Q6IF00	324 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	CCDC80	Q76M96	950 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	CALHM3	Q86XJ0	350 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	NRM	Q8IXM6	262 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	OR10S1	Q8NGN2	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	RAB24	Q969Q5	203 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	RASD2	Q96D21	266 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	CMBL	Q96DG6	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965		Q96M85	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	PKP2	Q99959	881 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	CITED1	Q99966	193 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	ALG12	Q9BV10	488 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	RABEP2	Q9H5N1	569 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	WDR76	Q9H967	626 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	IL19	Q9UHD0	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	VWF	P04275	2813 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965		A0A0G2JK05	382 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	OR6C6	A6NF89	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	SRRM5	B3KS81	715 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	ANKRD65	E5RJM6	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	FFAR1	O14842	300 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	RER1	O15258	196 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	FCN3	O75636	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	HLA-DPB1	P04440	258 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	MELTF	P08582	738 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	NR2C1	P13056	603 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	GYPE	P15421	78 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	ANOS1	P23352	680 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	PMEL	P40967	661 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	MTNR1A	P48039	350 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	PITPNB	P48739	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	PCBD1	P61457	104 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	AQP6	Q13520	282 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	MEP1B	Q16820	701 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATXN3-210	ENST00000507965	ZNF404	Q494X3	552 aa		4.59	□□□□□ -1.67

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