RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 TRILQ7L0X0 811 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 OR4D10Q8NGI6 311 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 LINC00052Q96N35 136 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 OR51B6Q9H340 312 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF286AQ9HBT8 521 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 B4GALT7Q9UBV7 327 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 F10P00742 488 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 BATF2Q8N1L9 274 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 PRR18Q8N4B5 295 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 OR52N4Q8NGI2 321 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SPIN2AQ99865 258 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 CHST6Q9GZX3 395 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ZFP64Q9NPA5 681 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 GPR173Q9NS66 373 aa11.89□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 PLPP3O14495 311 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 BCL2L11O43521 198 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 CFDP00746 253 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF728P0DKX0 622 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 GLB1P16278 677 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 GDF1P27539 372 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 FAM122BQ7Z309 247 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 NAXDQ8IW45 347 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 TERB2Q8NHR7 220 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 LUZP4Q9P127 313 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 HMSDA8MTL9 139 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 BET1O15155 118 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 GUSBP08236 651 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 GABRA1P14867 456 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 MSR1P21757 451 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 OPRM1P35372 400 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 RPS15P62841 145 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SLC38A6Q8IZM9 456 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 MOB1AQ9H8S9 216 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 WIF1Q9Y5W5 379 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 TNFSF12O43508 249 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SSR4P51571 173 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 MYBPHQ13203 477 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 CMTM1Q8IZ96 169 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 CNTD2Q9H8S5 307 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 TAF9BQ9HBM6 251 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 BIN3Q9NQY0 253 aa11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SYT13Q7L8C5 426 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 AGBL5Q8NDL9 886 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 MRGPRX4Q96LA9 322 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SGCZQ96LD1 299 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF649Q9BS31 505 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ANKUB1A6NFN9 424 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 HSPB6O14558 160 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 AQP8O94778 261 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 IFNA2P01563 188 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 CAMK2BQ13554 666 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 TAF9Q16594 264 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 CTHRC1Q96CG8 243 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 AMELYQ99218 206 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 IL9P15248 144 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 FASLGP48023 281 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 GAS1P54826 345 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ASB5Q8WWX0 329 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 IL1F10Q8WWZ1 152 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 RER1O15258 196 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 LAMTOR5O43504 91 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SERPINE2P07093 398 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 TBPP20226 339 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 CNR1P21554 472 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 RPS18P62269 152 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 MGAT2Q10469 447 aa11.87□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.86□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 FAM221AA4D161 298 aa11.86□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 M0R135 149 aa11.86□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 PIAS2O75928 621 aa11.86□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 TSC22D1Q15714 1073 aa11.86□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM200AQ86VY9 491 aa11.86□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.86□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ASB13Q8WXK3 278 aa11.86□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 TTC9Q92623 222 aa11.86□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 SEH1LQ96EE3 360 aa11.86□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF799Q96GE5 643 aa11.86□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 C12orf10Q9HB07 376 aa11.86□□□□□ -0.51
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms