RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 C10orf67Q8IYJ2 551 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MOSPD2Q8NHP6 518 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 BPIFA2Q96DR5 249 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MSL2Q9HCI7 577 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.31□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 A0A0U1RQK1 487 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1W2PRQ8 180 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 A6NDX4 124 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 GABRA5P31644 462 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 WDR4P57081 412 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 DGCR6Q14129 220 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 HCP5Q6MZN7 132 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 LINC00471Q8N535 108 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MAL2Q969L2 176 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 PHF21AQ96BD5 680 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SDSLQ96GA7 329 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF702PQ9H963 129 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MARCH7Q9H992 704 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 RPS6KA6Q9UK32 745 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 ODF3BA8MYP8 253 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 EFCAB9A8MZ26 197 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 H3BUI4 141 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 M0QX08 132 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 NDUFB2O95178 105 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 GPANK1O95872 356 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV4-59P01825 116 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 RPS6KA3P51812 740 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 TPTEP56180 551 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 HOXC5Q00444 222 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 BLMHQ13867 455 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MESTQ5EB52 335 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 PAGE3Q5JUK9 113 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 PGBD2Q6P3X8 592 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 COMMD1Q8N668 190 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.3□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SIGLEC5O15389 551 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 FBXO24O75426 580 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CCL2P13500 99 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 IDH3AP50213 366 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 TAS2R41P59536 307 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CTXN1P60606 82 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SELENOWP63302 87 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SLC35A2P78381 396 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MPP2Q14168 576 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 PIGWQ7Z7B1 504 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 HMGN2P46Q86SG4 172 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC18Q8N456 261 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SCCPDHQ8NBX0 429 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SPTSSAQ969W0 71 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 DCAF16Q9NXF7 216 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 LHFPL6Q9Y693 200 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 G3V4G9 280 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 RAMP3O60896 148 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 GRB2P62993 217 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 MAPRE2Q15555 327 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 KLHL22Q53GT1 634 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 C10orf111Q8N326 155 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 OR11H6Q8NGC7 330 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF570Q96NI8 536 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 DDOQ99489 341 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 ARPC5LQ9BPX5 153 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.29□□□□□ -1.4
PDE4D-210ENST00000503258 C17orf98A8MV24 154 aa6.28□□□□□ -1.4
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