RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486679.2

MYCBP2-208, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene MYCBP2, Length 545 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR1I1	O60431	355 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	NIPSNAP2	O75323	286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	SH3BGRL	O75368	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	PMS2P2	O95744	297 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	TGFA	P01135	160 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	IFNA17	P01571	189 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	LIMS3	P0CW19	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	LIMS4	P0CW20	117 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	CALCB	P10092	127 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	ABO	P16442	354 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	ACP1	P24666	158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	S100A2	P29034	98 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	CCR2	P41597	374 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC6A12	P48065	614 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPCS3	P61009	180 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	ACTA2	P62736	377 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	ACTG2	P63267	376 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	TNFRSF17	Q02223	184 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	IRF8	Q02556	426 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	HYAL1	Q12794	435 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	EFNB3	Q15768	340 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	SSX2	Q16385	188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	VWA2	Q5GFL6	755 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	ACOT7L	Q6ZUV0	252 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	HIST2H3A	Q71DI3	136 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	SSX9	Q7RTT3	188 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF546	Q86UE3	836 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	PARG	Q86W56	976 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	PAQR7	Q86WK9	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	COMMD2	Q86X83	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	APCDD1	Q8J025	514 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	INO80E	Q8NBZ0	244 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	BPIFC	Q8NFQ6	507 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	NANP	Q8TBE9	248 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	THEM6	Q8WUY1	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR5P2	Q8WZ92	322 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	RAB7B	Q96AH8	199 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	MALSU1	Q96EH3	234 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	LURAP1	Q96LR2	239 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	SAMD8	Q96LT4	415 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	PFDN5	Q99471	154 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	HRASLS	Q9HDD0	168 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	CTPS2	Q9NRF8	586 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	MRTO4	Q9UKD2	239 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	RASD1	Q9Y272	281 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MYCBP2-208	ENST00000486679	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	OBSL1	O75147	1896 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679		A0A1B0GWJ7	208 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	RNF222	A6NCQ9	220 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	GABRR3	A8MPY1	467 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679		G3V3Q6	166 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	NUPL2	O15504	423 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	P2RX6	O15547	441 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	GPR137B	O60478	399 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	LDB3	O75112	727 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	CLN5	O75503	358 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	RBBP9	O75884	186 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF432	O94892	652 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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