RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CTNSO60931 367 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 SUPT7LO94864 414 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 RCBTB2O95199 551 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 TTC4O95801 387 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 BGLAPP02818 100 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 THRAP10827 490 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 CD1EP15812 388 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 MYL9P24844 172 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 RGS6P49758 472 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF138P52744 262 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 DSTNP60981 165 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 TIMM10P62072 90 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC7A9P82251 487 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 TTLL9Q3SXZ7 439 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 RESP18Q5W5W9 173 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 STRADAQ7RTN6 431 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC6Q86X45 466 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM25Q86YD3 366 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF738Q8NE65 137 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10Z1Q8NGY1 313 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 DOK4Q8TEW6 326 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 IFT81Q8WYA0 676 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHF1Q96S99 279 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC38A1Q9H2H9 487 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 OR51B5Q9H339 312 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 RGS18Q9NS28 235 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 VNN3Q9NY84 501 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA8JA6NMD2 632 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 E7ENQ6 273 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTL6AO96019 429 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 MOSP00540 346 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 FABP3P05413 133 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5AL1P0C617 328 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF883P0CG24 379 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA8HP0CJ92 632 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 GIMD1P0DJR0 217 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF30P17039 623 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 CEACAM6P40199 344 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 MYCNOSP40205 109 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 MAGEA3P43357 314 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 XKP51811 444 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS23P62266 143 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 POU2AF1Q16633 256 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 C15orf32Q32M92 178 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 EPGNQ6UW88 154 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 NKAIN4Q8IVV8 208 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 STPG2Q8N412 459 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 NECAP1Q8NC96 275 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 CREB3L1Q96BA8 519 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF185Q96GF1 192 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM101Q96IK0 257 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 PAK5Q9P286 719 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 UVRAGQ9P2Y5 699 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 PCYOX1Q9UHG3 505 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC4EQ9ULY5 219 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 NFASCO94856 1347 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 FHOD3Q2V2M9 1422 aa4.38□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 EPOPA6NHQ4 379 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP92A6NM28 416 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDN34H7C241 214 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 FUT3P21217 361 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 GALR1P47211 349 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC35A1P78382 337 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 C2orf54Q08AI8 447 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 SMARCB1Q12824 385 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 STX4Q12846 297 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 GUSBP1Q15486 140 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 BSXQ3C1V8 233 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 CEND1Q8N111 149 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC52Q8N7C0 313 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAAF3Q8N9W5 541 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 NPBQ8NG41 125 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 RORBQ92753 470 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 NTAN1Q96AB6 310 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 ALS2CR12Q96Q35 445 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 ARV1Q9H2C2 271 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 ACOT13Q9NPJ3 140 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGGTB-209ENST00000473406 MED4Q9NPJ6 270 aa4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms