RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	OR4A47	Q6IF82	309 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF613	Q6PF04	617 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF534	Q76KX8	674 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MMD2	Q8IY49	270 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	WDR31	Q8NA23	367 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RNF149	Q8NC42	400 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	P2RY11	Q96G91	374 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	REEP6	Q96HR9	211 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PYURF	Q96I23	114 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	LOXL4	Q96JB6	756 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	LINC00477	Q96M19	166 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MIA2	Q96PC5	1412 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ADO	Q96SZ5	270 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SETD5	Q9C0A6	1442 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	2.79	□□□□□ -1.96	3e-7	■■■■□ 19.7
TTC3-214	ENST00000472398	CD109	Q6YHK3	1445 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM202	A6NGA9	273 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR4C46	A6NHA9	309 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZIC3	O60481	467 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PRAMEF10	O60809	474 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ATP5L	O75964	103 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MT-CO3	P00414	261 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	REG1A	P05451	166 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MPC1L	P0DKB6	136 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CT45A8	P0DMV1	189 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CT45A9	P0DMV2	189 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	HSD17B1	P14061	328 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GYPE	P15421	78 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SDC1	P18827	310 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TBP	P20226	339 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MAOA	P21397	527 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GCA	P28676	217 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SGSH	P51688	502 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RAB8A	P61006	207 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PSG6	Q00889	435 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	DUSP2	Q05923	314 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CSRP2	Q16527	193 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	EPGN	Q6UW88	154 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PIGZ	Q86VD9	579 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TMEM86B	Q8N661	226 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	HMGCLL1	Q8TB92	370 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GPR119	Q8TDV5	335 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SMAP2	Q8WU79	429 aa	Predicted RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	NUS1	Q96E22	293 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR52E6	Q96RD3	313 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	SDCBP2	Q9H190	292 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	OR51J1	Q9H342	316 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CPVL	Q9H3G5	476 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		2.79	□□□□□ -1.96
TTC3-214	ENST00000472398	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		2.79	□□□□□ -1.96

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