RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 LYPD8Q6UX82 237 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GSG1LQ6UXU4 331 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 Q6ZSR3 168 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TMPPEQ6ZT21 453 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CHMP1BQ7LBR1 199 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 LYG2Q86SG7 212 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 BEST3Q8N1M1 668 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GJC3Q8NFK1 279 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR2I1PQ8NGU4 316 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PP6455Q8WZ26 134 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ARL5BQ96KC2 179 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 B3GNT4Q9C0J1 378 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MFFQ9GZY8 342 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ARL6Q9H0F7 186 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CST11Q9H112 138 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 POFUT1Q9H488 388 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 IFT46Q9NQC8 304 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RDH8Q9NYR8 311 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF391Q9UJN7 358 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ANAPC10Q9UM13 185 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 POLR1DQ9Y2S0 133 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SPTBP11277 2137 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR14I1A6ND48 311 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CEACAM18A8MTB9 384 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 C9J4A7 227 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 I3L521 148 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SULT2B1O00204 365 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MEN1O00255 615 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 P2RY10O00398 339 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GOSR2O14653 212 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GMFGO60234 142 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TOXO94900 526 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GP1BAP07359 652 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ICAM2P13598 275 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 HLA-DOBP13765 273 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF17P17021 662 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CD34P28906 385 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SSTR2P30874 369 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 THBS4P35443 961 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PTGDSP41222 190 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CX3CR1P49238 355 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SPOCK1Q08629 439 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ECH1Q13011 328 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GFOD2Q3B7J2 385 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TOR2AQ5JU69 321 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 VAX1Q5SQQ9 334 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 C10orf128Q5T292 105 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 STPG1Q5TH74 334 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FAM69BQ5VUD6 431 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR5M10Q6IEU7 315 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF546Q86UE3 836 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GPAT4Q86UL3 456 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 NAA40Q86UY6 237 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 STEAP2Q8NFT2 490 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR5M9Q8NGP3 310 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR5M8Q8NGP6 311 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MITD1Q8WV92 249 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FAM122AQ96E09 287 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SPSB2Q99619 263 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 KLHDC3Q9BQ90 382 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PPA2Q9H2U2 334 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CA10Q9NS85 328 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 B3GAT1Q9P2W7 334 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 VDAC3Q9Y277 283 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 USP34Q70CQ2 3546 aa7.55□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 A0A0C4DFX4 3053 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR5H14A6NHG9 310 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 AGRPO00253 132 aa7.54□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ARPC5O15511 151 aa7.54□□□□□ -1.2
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