RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 OR51A4Q8NGJ6 313 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 OR10AC1Q8NH08 325 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 AKR7LQ8NHP1 331 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 OR51E1Q8TCB6 317 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 BORCS5Q969J3 196 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 STARD4Q96DR4 205 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 WBP1Q96G27 269 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 CMTM3Q96MX0 182 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 OPA3Q9H6K4 179 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 PLEKHA1Q9HB21 404 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 PLGRKTQ9HBL7 147 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 GPR84Q9NQS5 396 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 ASF1BQ9NVP2 202 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 V9GY05 133 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 A0A0G2JK05 382 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 A0A1B0GTI1 187 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 A0A1W2PPK0 400 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 RGS5O15539 181 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 ZNHIT1O43257 154 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 HLA-HP01893 362 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 SERPINA5P05154 406 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 GLI4P10075 376 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 EPXP11678 715 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 ZNF20P17024 532 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 CD40LGP29965 261 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 APLNRP35414 380 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 CAPZA1P52907 286 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 FOXF2Q12947 444 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 GABRA6Q16445 453 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 CEP78Q5JTW2 689 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 IDNKQ5T6J7 187 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 TMEM211Q6ICI0 200 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 PGAP1Q75T13 922 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 DOLPP1Q86YN1 238 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 OR5D14Q8NGL3 314 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 B3GNT2Q9NY97 397 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 MGAQ8IWI9 3026 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 IFITM5A6NNB3 132 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 MSTNO14793 375 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 TBX1O43435 398 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 DHRS3O75911 302 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 NCR1O76036 304 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 TOXO94900 526 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 LCATP04180 440 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 DBHP09172 617 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 PATE4P0C8F1 98 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 SLC2A1P11166 492 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 STOMP27105 288 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 THBS4P35443 961 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 GNALP38405 381 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 GLT8D1Q68CQ7 371 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 CCDC190Q86UF4 302 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 CDH26Q8IXH8 852 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 FAM169BQ8N8A8 192 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 OR1J2Q8NGS2 313 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 FGFBP3Q8TAT2 258 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 PP6455Q8WZ26 134 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 PPP1R14AQ96A00 147 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 SLC30A2Q9BRI3 323 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 NEK6Q9HC98 313 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 DAPK2Q9UIK4 370 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 RABL2BQ9UNT1 228 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 AMDHD2Q9Y303 409 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 E9PLN8 166 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 RAD51DO75771 328 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 ALX3O95076 343 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 PRB1P04280 392 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 CALCBP10092 127 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 BMP4P12644 408 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 DDOSTP39656 456 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 CAV3P56539 151 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 OR10A3P58181 314 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 MALLQ13021 153 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 TBC1D28Q2M2D7 210 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 HIKESHIQ53FT3 197 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 SFRP5Q5T4F7 317 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 ZBTB37Q5TC79 503 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 COLCA1Q6ZS62 124 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 SSX8Q7RTT4 187 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-203ENST00000460759 MRGPRGQ86SM5 289 aa11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms